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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 求助：对称有机大分子体系 如何同时扫描4个势能面？？？
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xzh410512206

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by kekexili_08 at 2015-07-15 21:09:06
分子坐标给我， 我给你试一下
这个结构， 找可能的稳定构象，不用扫描也能找全吧。 毕竟刚性比较强。...

好的  太谢谢您了
你是用什么算，gjf格式发给你可以吗
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11楼2015-07-15 22:13:07
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xzh410512206

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by kekexili_08 at 2015-07-15 21:09:06
分子坐标给我， 我给你试一下
这个结构， 找可能的稳定构象，不用扫描也能找全吧。 毕竟刚性比较强。...

多谢！！！gjf格式 发给你可以吗    我本来正郁闷呢   优化完  两边角度完全不一样
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12楼2015-07-15 22:14:16
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xzh410512206

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by kekexili_08 at 2015-07-15 21:09:06
分子坐标给我， 我给你试一下
这个结构， 找可能的稳定构象，不用扫描也能找全吧。 毕竟刚性比较强。...

这个gjf格式   我已经把4个角度起始值（25°）调好，，麻烦您帮我试一下了！
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  • 附件 1 : 9.gjf
    • 2015-07-16 08:37:02, 25.24 K
13楼2015-07-16 08:38:48
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xzh410512206

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-15 10:32:57
是要同时扫4个角度吗？就是说4个二面角一起变化？
高斯扫描都是一个角一个角变的。。。

还是这个分子，我想固定8-7-6-5这个二面角，扫描4-3-2-1所成的二面角，对其他部分进行优化。这一过程能保证9-7-6-5不变吗？
关键词那行，还有坐标那  是怎么设置的？？
求助：对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面？？？
8.png
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14楼2015-07-24 14:56:41
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xzh410512206

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-15 10:32:57
是要同时扫4个角度吗？就是说4个二面角一起变化？
高斯扫描都是一个角一个角变的。。。

复制输出文件  太大了    一黏贴网页就没响应    这个log您可以看吧
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  • 附件 1 : 110.log
    • 2015-09-11 11:40:13, 11.34 M
15楼2015-09-11 11:40:54
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xzh410512206

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-15 15:09:18
说明只扫了4321这个二面角，其他几个二面角的变化应该是根据不同的4321优化结构造成的。
如果只扫9个点的话，可以直接写9个计算单点能的文件即可，手动修改其中的4个二面角。...

我要把它固定为110°
难道你看到的结果跟我看的你一样吗
扫描的前5步如下
求助：对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面？？？-1
1.png


求助：对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面？？？-2
2.png


求助：对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面？？？-3
3.png


求助：对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面？？？-4
4.png


求助：对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面？？？-5
5.png
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16楼2015-09-11 14:16:50
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
16楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-09-11 14:16:50
我要把它固定为110°
难道你看到的结果跟我看的你一样吗
扫描的前5步如下

1.png

2.png

3.png

4.png

5.png
...

你给我的log文件里面是 5 6 7 8 F
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17楼2015-09-11 14:54:15
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xzh410512206

银虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-09-11 14:54:15
你给我的log文件里面是 5 6 7 8 F...

不好意思  没理解您的意思      
我就是想要固定5 6 7 8 110.0 F   而且我的输入文件也是这样设置的，但结果里，5 6 7 8是变的（如上5个图）
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18楼2015-09-11 15:41:48
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-09-11 15:41:48
不好意思  没理解您的意思      
我就是想要固定5 6 7 8 110.0 F   而且我的输入文件也是这样设置的，但结果里，5 6 7 8是变的（如上5个图）...

你给我的输入文件里是固定在110，我没有全部看，随机选了其中的几个结构，角度没有变化
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19楼2015-09-12 09:08:14
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virtualzx

木虫 (著名写手)
你真的想好了吗，扫描四个坐标可是大工程，得到的是四维点阵。一个方向十个点，就要做一万组限制性优化，这么多结果，你打算如何处理呢？

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20楼2015-09-12 09:16:11
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