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wabl

新虫 (小有名气)

[求助] 用MS的DMol模块做周期性已有1人参与

求助知道的大神们:如果想用MS的DMol模块做一下晶体的周期性,是建成超胞还是做一个晶胞再设周期性更合理呢
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
说到晶体自然会讲到晶胞,本身就是周期性的;要不要把晶胞扩展成超胞根据实际需求来。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2015-07-15 08:45:06
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wabl

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-07-15 08:45:06
说到晶体自然会讲到晶胞,本身就是周期性的;要不要把晶胞扩展成超胞根据实际需求来。

谢谢您的回答,我还想问一下在什么情况下需要建成超胞呢?因为DMol3可以做周期性的 (所以想从单胞直接设置),如果我们只是想得到优化后的能量的话那还需要建成超胞吗。
3楼2015-07-15 10:09:23
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
wabl: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢版主对小菜鸟的耐心解答 2015-07-15 14:26:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by wabl at 2015-07-15 10:09:23
谢谢您的回答,我还想问一下在什么情况下需要建成超胞呢?因为DMol3可以做周期性的 (所以想从单胞直接设置),如果我们只是想得到优化后的能量的话那还需要建成超胞吗。...

那计算晶胞能量即可。晶胞是最简单元的一种,超胞是最简单元的重复。
但模型太小时,因模型尺寸影响计算精度时,需要建立超胞。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2015-07-15 10:15:32
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wabl

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-07-15 10:15:32
那计算晶胞能量即可。晶胞是最简单元的一种,超胞是最简单元的重复。
但模型太小时,因模型尺寸影响计算精度时,需要建立超胞。...

恩,那就是说无论是否建立超胞,都对total energy是没有影响的是吗
5楼2015-07-15 11:17:47
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wabl at 2015-07-15 11:17:47
恩,那就是说无论是否建立超胞,都对total energy是没有影响的是吗...

模型越大,能量在数值上越大。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
6楼2015-07-15 11:38:46
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