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大姚

金虫 (小有名气)

[求助] Topomer CoMFA 已有1人参与

各位老师,我是SYBYL学习新手,学习Topomer CoMFA的过程中遇到问题:
1、打开我的小分子数据集(hits格式文件)后,电脑显示Your new dataset has no biological data. You have the choice of: -Exit and use dbtranslate to put values into a hitlist. -Load your dataset into a  spreadsheet and import values and save as a hitlist.请问我要怎么为我的小分子数据集添加生物活性数据?是在网上的数据库下载吗?有无这种类型的数据库?
2、在文献中列出的小分子数据集(IC50值、PIC50值等)的word文档,怎么导入到sybyl中去?是手动的一个一个画,还是集体导入?
PS:我用的是 SYBYL-X 2.0

万分焦急,如若能帮助解决问题,必当重谢!!!
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janzo

新虫 (初入文坛)

2楼2016-05-07 19:09:54
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zfb601

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
大姚: 金币+20, ★有帮助 2016-05-11 20:54:14
月只蓝: 金币+5, 感谢应助。 2016-05-11 20:57:29
1.生物活性来自文献数据或者你自己的活性实验数据啊,你任意拿来一个结构做QSAR肯定是不可能的啊;
2.生物活性数据可以自己一个一个输入(如果数量很较少的话),或者活性数据保存为一个txt文档,一个活性数据一行,用分子表单的import命令即可导入到表单中,注意化合物名称与活性数据的对应,当然2.0可以在txt中建立两列,第一列为化合物名称,第二列为活性数据,方便导入,不易出错。
3楼2016-05-10 21:51:35
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