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ampu314

新虫 (初入文坛)

[交流] 有关微生物,求助~~~

求助前辈~~~
小丫头我最近分到一株菌,测序后,发现和本实验室另一博士分到的可能是相同的一个,我是用BIOEDIT比较同源性97%,这样能判定吗?
我是用PCR产物直接测序,是否要TA克隆后才够准确。
还有,为什么在RDP上下的20个模式菌株,他们彼此也有同种的?那说明是一个种吗?是不是和模式菌株比队,要>99%才能鉴定到种?
3Qvery much!
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

序列比对之后,如果相似性大于等于97%,不能确定就是同一株菌。因为即使相似性在97%,也可能是不同的菌。我们只能说,他们相似性在97%以上,而不能说是同一种菌。一般来讲,我们可以认为他们是同一属的菌,但也不是100%的就是同一属。如果也确定是不是同一种,必须做分子杂交等实验,来定种了。
2楼2008-08-05 13:26:25
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