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Ranyanxiong

金虫 (初入文坛)

[求助] 分子吸附在Ni(111)2*3的超胞表面的时候最上面一层原子有一排原子消失 已有1人参与

小弟新手,有个问题想请教一下各位虫友。
我将一个分子吸附在Ni(111)2*2  3*3  4*4 的超胞上时表面原子层没有发生变化,但是吸附在2*3  3*4 的超胞表面时表面最上面一层原子会自动少一排,不知道是什么原因?这些表面都是优化之后才进行吸附的,但是我在没有优化的表面吸附的时候并没有这种现象,所以另外一个问题就来了,吸附分子的时候是应该先优化表面再吸附到优化后的表面还是直接将分子吸附到未优化好的表面呢?我个人倾向于吸附到优化后的表面,还请各位虫友各抒己见,希望大家给我点意见,特别是第一个问题出在哪里,谢谢!
(PS:图1为Ni(111)2*3超胞,图2为将H原子放上去之后的图)

分子吸附在Ni(111)2*3的超胞表面的时候最上面一层原子有一排原子消失
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分子吸附在Ni(111)2*3的超胞表面的时候最上面一层原子有一排原子消失-1
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雪儿123

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我们做练习的时候,是将分子优化  ;被吸附的优化,然后进行吸附  再优化。

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2楼2015-07-21 11:36:50
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Ranyanxiong

金虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 雪儿123 at 2015-07-21 11:36:50
我们做练习的时候,是将分子优化  ;被吸附的优化,然后进行吸附  再优化。

不好意思,一直以为小木虫都没人在用了,好长时间也没人回复,我也都不怎么上小木虫了,您能回复真的是感激不尽啊!我的那个问题其实应该不算问题,那种现象是正常的,只是显示问题,因为本身晶胞就是2*3,只是显示成3*4,只是显示效果而已,吸附之后只是还原了而已。我们课题组搞计算的人不多,小木虫现在貌似大家都不咋用了,能否留下您的QQ号方便讨论呢?不胜感激~
3楼2015-11-09 10:33:39
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