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swordzj858

至尊木虫 (著名写手)

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[交流] 【求助】autodock4.0的问题

请教各位，我用autodock4.0做对接时，先选择蛋白分子原始的配体作为配体分子(我把原始的配体和我要对接的分子都作为ligand读入），用Box Opptions中的Center on ligand设定Grid Box的参数，然后再选择我所要对接的新的化合物作为配体分子与蛋白进行对接，但是进行RUN-autodock时出现如下错误：
189771 energies found for map 3
Minimum energy = -1.54,  maximum energy = 371007.44

Time taken (s): Real= 0.23,  CPU= 0.24,  System= 0.00

Min= -1.544 Mean= 12122.081 Max= 371007.438

DPF> map 2OH4.N.map                      # atom-specific affinity map

/usr/local/bin/autodock4: I'm sorry; I can't find or open "2OH4.N.map"
________________________________________________________________________________

/usr/local/bin/autodock4: I'm sorry; I can't find or open "2OH4.N.map"
Real= 0.84,  CPU= 0.80,  System= 0.02
________________________________________________________________________________
请教各位是怎么回事呢？我用这种方法设定Grid Box的参数可以么？

[ Last edited by swordzj858 on 2008-8-2 at 10:41 ]

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