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wh7690703

木虫 (正式写手)

[交流] 求助!PCR引物设计

大家好!
1.请问如何根据已知链霉菌属一些菌的编码葡萄糖异构酶的核苷酸序列(DNAMAN比对结果相似性高达90%以上)来设计我手头上这个链霉菌属(NCBI上查不到其编码葡萄糖异构酶的基因信息)的引物?
2.那要是在CDS两端直接设计引物可否?
5端和3端碱基基本上都一样,只有1至2个不同,那么在这种情况下,可否直接按照互补原则来设计引物?
3.可以利用此保守区设计引物,可以拿一个种属同源性最高当作主要模板,
可以直接设计特异性引物,或兼并性引物吗。
两种都可以吗。

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wh7690703

木虫 (正式写手)

求助!PCR引物设计

为何无人回答?我很纳闷。。。
第一次求助,却无人问津
难道是我给的金币少。
郁闷ing
2楼2008-08-01 23:05:51
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iamrohy

银虫 (初入文坛)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
如果这是高度保守序列的话,你用同一属的通用引物就可以
好多人都是这样去检测检测未知菌种的
多俗呀,不写了
3楼2008-08-01 23:10:44
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playboy723

金虫 (正式写手)

可以啊    如果你确信他们的基因有>90%的序列是相似的    那就拿其他种的引物扩呗    肯定能扩出来的    我以前就用人的基因来扩猴子的相同基因   扩出来了   很好的    退火温度可以低一些   这样效果会好一些
4楼2008-08-04 10:53:03
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