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swordzj858至尊木虫 (著名写手)
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[交流]
【求助】autodock4.0中Grid Box参数的设定
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请教各位高手，我用autodock4.0对接后分析结果发现配体分子和受体分子距离好远，请问如何确保Grid的Center在蛋白上呢？ 我对接的时候都把原蛋白中的配体删除了，然后用新的化合物进行对接，请问这种情况怎么设置参数？ “Center Grid Box是要求输入grid box的中心坐标值，是不是选择“Center on macromolecule”呢？ “number of points"是不是设置为60左右比较合适？ x,y,z的center一般如何设置呢？ |
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2楼2008-08-01 11:50:23