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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【求助】protein-protein docking 软件推介一下啊
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wfeigo

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】protein-protein docking 软件推介一下啊

我知道的 免费可用 zdock, 3D-dock， accelrys 有 Rdock, Mdock, 不知道有没有别的好用的软件了，推荐一下 啊，

[ Last edited by zzgyb on 2008-8-5 at 10:02 ]
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1楼 2008-07-31 18:22:56
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taot

银虫 (小有名气)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
可以用Dock.
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2楼2008-08-01 00:47:03
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chemhz

铁杆木虫 (正式写手)
同问，有没有考虑部分柔性的protein-protein docking 软件？
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3楼2008-08-01 15:47:09
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wfeigo

新虫 (初入文坛)
一般都是刚性对接 打分  后优化，mdock 3D-dock 都这样好像
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4楼2008-08-01 18:20:58
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wjmed

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
3D-dock和accelrys 的 Rdock是同一个软件，不过前者是免费的，后者整合在了商业软件中
其他的还有
HEX
HADDOCK
ROSETTA
ESCHER（整合在VEGA ZZ中）
都是免费的，其中HEX以及VEGA ZZ（windows版本）是图形界面的

[ Last edited by wjmed on 2008-8-21 at 07:58 ]
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Timeandtidewaitsfornoman!
5楼2008-08-21 07:52:21
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