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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助：5'RACE的问题！
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wuushu

金虫 (正式写手)

[交流] 求助：5'RACE的问题！

做杂色鲍免疫基因的5'RACE，却总是弥散状条带，换了很多引物、模板还是一样。
最近同学做了个Oligo dT的模板，成功扩出了5'RACE条带（其他免疫基因）。但我用这模板后，跑电泳就只见亮带停在加样孔，请问这是怎么回事？
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1楼 2008-07-31 10:21:44
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taishuai2004

lliu  
同意他的观点
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5楼2008-08-04 08:26:49
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taishuai2004

是不是有基因组DNA污染啊


却总是弥散状条带  做巣式PCR了吗
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2楼2008-07-31 13:49:22
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wuushu

金虫 (正式写手)
应该不是基因组DNA污染，因为鲍鱼基因组DNA我有提取过，用1000的MAKER可以跑出来，不会在加样孔

巣式PCR肯定做了啊
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该把乱七八糟的业余爱好收收了,专注于偶亲爱的生物!PaperandEnglish!
3楼2008-07-31 15:42:48
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lliu

新虫 (小有名气)
根据我的经验，这可能是你的RNA或者cDNA的质量问题(导致你的PCR模板太少）。建议你用特异性的引物对某已知基因扩增一下，作为对照看看你的模板质量。

当然，引物设计的水平，也是有关系的。
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4楼2008-08-01 02:48:40
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