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huiyuli

金虫 (小有名气)

[交流] 【紧急求助】能够由17个氨基酸做成hairpin蛋白质结构的软件

各位高手:
     我现在想要由17个氨基酸片段做成hairpin形式的二级结构,请问各位高手用那个软件比较好呀!

[ Last edited by zzgyb on 2008-7-31 at 08:16 ]
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xxffliu

铜虫 (小有名气)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
比较简单的方法,你找到一个序列长度类似的hairpin晶体结构(PDB里应该有,你做这种体系的话也应该知道什么蛋白有这样的结构),然后在sybyl把残基按照你的序列一个一个突变掉。这样只是主链符合要求,侧链取向无法预测。
2楼2008-07-30 20:10:14
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huiyuli

金虫 (小有名气)

感谢楼上的回答

非常感谢楼上给予的回答,但是不知道怎样才能产生突变
3楼2008-07-31 13:37:37
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