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swordzj858

至尊木虫 (著名写手)

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[交流] 【求助】Autodock4中的文件存放问题

请教各位高手，我用的是Windows版本的Autodock4.0，是AutoDockTools1.5.2工具，请问这是不是要求把配体和受体的相关文件必须放在固定的文件夹下呢？如果是，请问文件夹的路径是什么？我随便放在一个文件夹下，但是最后一步运行Run-Autodock4时一直出现问题。请各位高手指教。

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1楼 2008-07-29 15:51:36

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suyuehua

金虫 (初入文坛)

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clean up

PDB 文件变成PDBQT文件前,一定要clean up吗?应当用何软件处理.

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8楼2008-09-13 17:34:10

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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

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swordzj858(金币+2,VIP+0):Thanks
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！

是的，autodock4和autogrid4必须放在同一个文件夹下，而且如果你要从ADT来启动计算的话，由于它带路径运行不成功，所以建议你在用ADT准备好文件之后，在命令行直接输入命令来运行，这很简单。
而如果你实在要用ADT来运行的话，试着将preferences中的启动路径改为你要运行的当前路径，然后在对话框中不要带任何路径

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