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shesheshebie新虫 (初入文坛)
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[交流]
MRI图像分割的准备阶段，再发一贴
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之前发过一个帖子，由于发贴经验不足，被灌水了，现在再发一个帖子，本来应该是求助帖，但是我发个交流贴，有帮助的人手动发金币，这样也可以把。。。。 首先，我要做的是一个MRI脑部图分割，导师给了我一个数据集。然而，此时需要一个已经分割好的结果，然后跟我自己分割出来的结果计算一个值作为标准（金标准啥的，目前没太了解这些。我要问不是这个），目前导师给的这个数据集没有已经分割好的成品，需要自己手动分割作为比较（几十张图，手动分割白质，灰质，脑脊液这些东西，不知道工作量到底。。。），并且大家都不是医生，自己分割应该会出错，何况这种东西每个人分割的结果也不同。目前需要一个已经分割好的成品。后来我找到了一个网站，说是有分割好的样本。但是后来导师又说必须要用他给的那个数据集。。。 我想问问几个问题：1.非医护人员手工分割MRI脑部图的做法是否靠谱？ 2.如果有人做过类似工作，是否可说一下，手动分割一层图像大概要多久？（每个人脑几十或者一百多层图像。。。吓人阿） 3.是否有人用过ADNI数据，里面能否找到已经分割好的图像？？ |
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2楼2015-06-24 13:00:55
samggyy
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shesheshebie: 金币+10, 非常感谢您的详细回答，给了最高评分了。我去看看这个软件。 2015-06-24 20:16:13
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shesheshebie: 金币+10, 非常感谢您的详细回答，给了最高评分了。我去看看这个软件。 2015-06-24 20:16:13
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不知道你为什么要手动分，而且你老板没有这方面的经验去指导你也很让人吃惊。 下面是我的一些回答，希望对你有用。 1.非医护人员手工分割MRI脑部图的做法是否靠谱？ 没什么靠不靠谱的，训练过后你也可以做。 2.如果有人做过类似工作，是否可说一下，手动分割一层图像大概要多久？（每个人脑几十或者一百多层图像。。。吓人阿） 做过肿瘤手动分割，大概2-3个小时一组数据。 3.是否有人用过ADNI数据，里面能否找到已经分割好的图像？？ 很难找到已经分割好的图像。因为耗时耗力。 如果是白质，灰质，脑脊液的分割（前提是你扫描的是正常人，而不是那些有非常大形变的病人），可以直接使用SPM，http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ 稍微懂一点Matlab就可以使用SPM了。而且这个软件在很多实验中都validate过，效果很好。 |
3楼2015-06-24 19:34:34
shesheshebie
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5楼2015-06-25 13:29:01
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