24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 551  |  回复: 7
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

素婕求学

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有自己编程算CNT或Graphene的嘛?急于求助中。。。。。。

本人自己编程算的graphene, 用的是second generation REBO potential,在NVT系综下模拟,没有加任何边界条件。现在用不同的时间步长来算,发现时间步长大一点的,系统算到1000步就崩溃了;时间步长小一点的,系统温度能达到设定温度,从能量变化趋势上来看,总能量呈下降趋势,动能没什么变化(这应该和加了温度调控有关)。我想问下,这样的情况属于正常吗?有没有人算过相类似的东西呢?你在NVT系综下算时,系统呈现出什么状态呢?我现在都不知道该如何调这个程序呢,茫然中~~~~~~~~~
望高手指点,万分感谢。。。。。。。。。。。。。。。。。

另外,我在想一个问题,对于像carbon nanotube or graphene等有具体尺寸和结构本身就属于纳米尺度的材料,在用分子动力学模拟时,同样需要建立模拟盒,需要使用一定的边界条件,如周期性边界条件嘛? 如果需要使用周期性边界条件,该如何使用呢?好像不是简单的按照任一原子离开元胞,就有镜像的原子进来的原则吧?

希望高手赐教,这两天要给老板交结果,心急如焚啦~~~~~~~~~

[ Last edited by 素婕求学 on 2008-7-29 at 09:25 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
周期性边界条件不会破坏键的,比如简单的一维情况:
|-a-b-c-d-| (注意这里d-a是成键的).
虽然如果d原子从右侧出去会从左侧回来,变成
|-d-a-b-c-| (注意这里c-d是成键的),
但是d-a以及c-d的成键关系是没变的
5楼2008-07-29 11:12:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

素婕求学

铁虫 (小有名气)

高手们都起床了嘛?
自己来顶
2楼2008-07-29 09:26:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
时间步长过大确实容易导致结构变乱,尤其是温度较高或远离平衡结构的情况,具体时间步长的量级和势函数也有关系,可以参考使用同一势函数的文献
做NVT体系,最初的驰豫阶段总能量确实应是逐渐降低的,动能不变,而势能在逐渐降低,但驰豫一段时间之后总能应该就趋于恒定,因为已经找到势能最低的结构,如果是这样的话程序就应该没太大问题了.
周期边界条件就是你说的那样吧,计算距离时注意与镜像原子的距离就可以了
3楼2008-07-29 09:49:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

素婕求学

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by acridine at 2008-7-29 09:49:
时间步长过大确实容易导致结构变乱,尤其是温度较高或远离平衡结构的情况,具体时间步长的量级和势函数也有关系,可以参考使用同一势函数的文献
做NVT体系,最初的驰豫阶段总能量确实应是逐渐降低的,动能不变,而势能 ...

非常谢谢!!!!!!!!!!

不过,我还是觉得周期性边界条件在碳管或者graphene中的应用应该有特殊处理的方法,因为如果应用镜像原则来处理,从元胞左边出去的碳原子,会从右边补充进来,那碳原子间的键作用关系就会打破,六边形形状的结构就不能保持了。这个到底该怎么处理呢?
跪请大侠们指点。。。。。。。。。。。。。。。。。。
4楼2008-07-29 10:26:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +8 努力奋斗112 2026-04-06 8/400 2026-04-07 19:41 by macy2011
[考研] 270分求调剂 +6 maxjxbsk 2026-04-01 6/300 2026-04-07 12:53 by flydream1314
[考研] 283求调剂 +18 A child 2026-04-04 18/900 2026-04-07 12:30 by 1018329917
[考研] 材料调剂 +17 小刘同学吖吖 2026-04-06 18/900 2026-04-07 11:41 by 诗与自由
[考研] 0703化学调剂 348分 +8 唉我超真没招了 2026-04-06 8/400 2026-04-07 08:19 by houyaoxu
[考研] 一志愿生物与医药,296分,求调剂 +11 66鹿 2026-04-03 13/650 2026-04-06 21:45 by 52305043001
[考研] 生物学求调剂 一志愿沪9,326分 +6 刘墨墨 2026-04-06 6/300 2026-04-06 19:36 by lijunpoly
[考研] 315求调剂 +5 &123456789 2026-04-05 5/250 2026-04-05 19:55 by nepu_uu
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +10 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-04 10/500 2026-04-05 18:51 by 蓝云思雨
[考研] 282求调剂 +3 aaa车辆 2026-04-01 3/150 2026-04-05 17:03 by yulian1987
[考研] 工科277分求调剂材料 +8 上了上了上哦 2026-04-05 9/450 2026-04-05 13:05 by wwytracy
[考研] 求生物学专业调剂-332分 +5 云朵遛弯指南 2026-04-04 5/250 2026-04-04 10:05 by rzh123456
[考研] 266求调剂 +8 学员97LZgn 2026-04-03 8/400 2026-04-04 09:02 by 20021109
[考研] 387求调剂 +4 爱吃片豆土 2026-04-03 5/250 2026-04-04 08:10 by 岸上的一条鱼
[考研] 282求调剂 +20 ycy1201 2026-04-01 22/1100 2026-04-04 00:42 by userper
[考研] 材料专硕322分 +13 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 13/650 2026-04-03 16:08 by 哦哦123
[考研] 315分 085602 求调剂 +15 26考研上岸版26 2026-04-02 15/750 2026-04-03 12:45 by xingguangj
[考研] 一志愿北京科技材料科学与工程288分,求调剂 +14 是辰啊 2026-04-02 14/700 2026-04-02 21:10 by dongzh2009
[考研] 一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂 +8 双马尾痞老板2 2026-04-02 9/450 2026-04-02 14:45 by 5896
[考研] 求调剂,一志愿南京师范大学计算机专硕,初试373,六级通过, +3 计算机追梦人 2026-04-01 3/150 2026-04-02 07:57 by fxue1114
信息提示
请填处理意见