24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 556  |  回复: 7
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

素婕求学

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有自己编程算CNT或Graphene的嘛?急于求助中。。。。。。

本人自己编程算的graphene, 用的是second generation REBO potential,在NVT系综下模拟,没有加任何边界条件。现在用不同的时间步长来算,发现时间步长大一点的,系统算到1000步就崩溃了;时间步长小一点的,系统温度能达到设定温度,从能量变化趋势上来看,总能量呈下降趋势,动能没什么变化(这应该和加了温度调控有关)。我想问下,这样的情况属于正常吗?有没有人算过相类似的东西呢?你在NVT系综下算时,系统呈现出什么状态呢?我现在都不知道该如何调这个程序呢,茫然中~~~~~~~~~
望高手指点,万分感谢。。。。。。。。。。。。。。。。。

另外,我在想一个问题,对于像carbon nanotube or graphene等有具体尺寸和结构本身就属于纳米尺度的材料,在用分子动力学模拟时,同样需要建立模拟盒,需要使用一定的边界条件,如周期性边界条件嘛? 如果需要使用周期性边界条件,该如何使用呢?好像不是简单的按照任一原子离开元胞,就有镜像的原子进来的原则吧?

希望高手赐教,这两天要给老板交结果,心急如焚啦~~~~~~~~~

[ Last edited by 素婕求学 on 2008-7-29 at 09:25 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
周期性边界条件不会破坏键的,比如简单的一维情况:
|-a-b-c-d-| (注意这里d-a是成键的).
虽然如果d原子从右侧出去会从左侧回来,变成
|-d-a-b-c-| (注意这里c-d是成键的),
但是d-a以及c-d的成键关系是没变的
5楼2008-07-29 11:12:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

素婕求学

铁虫 (小有名气)

高手们都起床了嘛?
自己来顶
2楼2008-07-29 09:26:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
时间步长过大确实容易导致结构变乱,尤其是温度较高或远离平衡结构的情况,具体时间步长的量级和势函数也有关系,可以参考使用同一势函数的文献
做NVT体系,最初的驰豫阶段总能量确实应是逐渐降低的,动能不变,而势能在逐渐降低,但驰豫一段时间之后总能应该就趋于恒定,因为已经找到势能最低的结构,如果是这样的话程序就应该没太大问题了.
周期边界条件就是你说的那样吧,计算距离时注意与镜像原子的距离就可以了
3楼2008-07-29 09:49:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

素婕求学

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by acridine at 2008-7-29 09:49:
时间步长过大确实容易导致结构变乱,尤其是温度较高或远离平衡结构的情况,具体时间步长的量级和势函数也有关系,可以参考使用同一势函数的文献
做NVT体系,最初的驰豫阶段总能量确实应是逐渐降低的,动能不变,而势能 ...

非常谢谢!!!!!!!!!!

不过,我还是觉得周期性边界条件在碳管或者graphene中的应用应该有特殊处理的方法,因为如果应用镜像原则来处理,从元胞左边出去的碳原子,会从右边补充进来,那碳原子间的键作用关系就会打破,六边形形状的结构就不能保持了。这个到底该怎么处理呢?
跪请大侠们指点。。。。。。。。。。。。。。。。。。
4楼2008-07-29 10:26:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本科郑州大学,一志愿华东师范大学282求调剂 +20 熊哥xtk 2026-04-07 23/1150 2026-04-07 22:51 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南科大生物学297分,求调剂推荐 +8 Y-yyusx 2026-04-06 9/450 2026-04-07 19:38 by biomichael
[考研] 22408 318分求调剂 +4 勤奋的小笼包 2026-04-06 6/300 2026-04-07 15:05 by 纸鹤555
[考研] 求调剂 +4 电气小神童 2026-04-04 6/300 2026-04-07 00:14 by guanxin1001
[考研] 071000生物学调剂 +7 拉提桃 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:55 by 52305043001
[考研] 专硕0854初试考材科基,求调剂 +6 3220548044 2026-04-06 9/450 2026-04-06 10:26 by barlinike
[考研] 0817化学工程与技术求调剂,一志愿中海洋319 +14 lv945 2026-04-04 14/700 2026-04-06 10:20 by 蓝云思雨
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +6 ioodiiij 2026-04-04 6/300 2026-04-05 10:09 by guoweigw
[考研] 本科211 分数293请求调剂 +4 莲菜就是藕吧 2026-04-01 4/200 2026-04-04 22:32 by hemengdong
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-04 20:37 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +6 朔朔话 2026-04-02 7/350 2026-04-04 19:16 by 蓝云思雨
[考研] 数二英二348求调剂 +4 hxdzj1 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:25 by zhq0425
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:06 by arrow8852
[考研] 工科341分调剂 +3 洛多罗 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:20 by 1753564080
[考研] 求材料调剂 一志愿南昌大学 328分 +5 yyy..... 2026-04-03 5/250 2026-04-03 13:46 by 百灵童888
[考研] 330求调剂 +3 白神呜呼呼 2026-04-02 3/150 2026-04-03 10:15 by 蓝云思雨
[考研] 调剂 +7 祉岷. 2026-04-02 7/350 2026-04-03 09:11 by 花呗还欠600
[考研] 348求调剂 +6 吴彦祖24k 2026-04-02 6/300 2026-04-02 14:07 by 给你你注意休息
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 13:03 by yulian1987
[考研] 348环境工程调剂 +3 吴彦祖24k 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:14 by nanaliuyun
信息提示
请填处理意见