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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » [交流］单机并行安装vasp
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junyjin2

金虫 (小有名气)

[交流] [交流］单机并行安装vasp

有几个问题一直不明白，请大家帮忙看看，谢谢大家先。
1、vasp的串行和并行安装的区别在那里？
2、单机可以并行安装vasp吗？
3、如果可以单机并行安装vasp，那么数据库有那些？
再次谢谢大家！

[ Last edited by wuchenwf on 2009-6-21 at 21:12 ]
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1楼 2008-07-28 20:16:40
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jghe

金虫 (著名写手)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
1.串行用makefile前面部分不用MPI那部分，并行要用MPI部分
2.如果一个cpu 就不用并行了
3.没试过
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2楼2008-07-28 20:30:58
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)

…………

优秀版主优秀版主
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=887258
请参阅这个！！
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…………
3楼2008-07-28 22:42:11
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madonion

金虫 (正式写手)
fegg7502(金币+0,VIP+0):thanks
如果是单机多核的当然可以
不知道你说的数据库指什么，时makefile还是mkl
我在双xeon 5410和q6600的机器上都编译过并行版的vasp
makefile是自己改出来的，用的时intel的fortran,intel的mkl和intel的mpi（就是装了个ictce3.1呵呵）
不过我觉得intel的ifort 10有问题，要么用ifort9 要么升级ifort到最新版
否则用o3出错
不知道大家有没有这个情况
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4楼2008-07-29 19:18:28
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junyjin2

金虫 (小有名气)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):thanks
先谢谢大家的指点，我前两天用单核的计算机（cpu 3.0）安装了vasp，所用编译器是intel 10.1.015, 非商业版本，数据库是fftw和Gotoblas, 并进行了测试，发现测试结果有偏差，所以我猜想是不是串行安装的结果，（当然也可能与数据库的选取有关），网上（包括论坛）大多讨论的是vasp的并行安装，看来我的机器是不能并行安装了。
3楼的虫友说intel 10有问题，不知是说编译时有问题，还是计算结果有问题(也许我的测试结果的偏差与编译器也有关系)。我在编译时，也是用O3，编译没出过错。
还有就是想再问问各位虫友，有没有可能自己组装一个8个cpu的计算机，大概得多少钱？
这方面的资料，我一点没有，不知在哪里能下载。
希望更多的虫友跟贴，大家都能互相学习，共同提高，再次谢谢大家！
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5楼2008-07-30 20:22:35
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madonion

金虫 (正式写手)
★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):不错，很有借鉴价值
我现在用的机器是淘宝上买的dell准系统然后自己装的，可以说是现在最便宜的8核机器了，两个5410，8gfb内存，上普通sata硬盘的话1w出头就能下来
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6楼2008-07-31 10:40:37
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yuanqh_2006

新虫 (初入文坛)
★ ★
wuli8(金币+2,VIP+0):3X!鼓励新虫！(*^__^*) ……
单机的也可以安装并行版本，前提是你的单机是多核或者多cpu的，其并行可以用mpi，但是多核的并行用mpi效率并不是太高，用OpenMP效率会高点，但有一个问题是openmp不能用于机器之间的并行。
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7楼2008-07-31 14:22:53
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
的确，ifc10以上要是用o3就会出错。可以编译成功，但是计算结果不对，而且差的很多。
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8楼2008-08-01 19:43:24
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junyjin2

金虫 (小有名气)
★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):好的
看来我还得尝试一下9.0的编译器，等结果出来我再向大家汇报。
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9楼2008-08-01 21:30:06
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madonion

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
wuchenwf(金币+3,VIP+0):xiexie
按intel网站说的好像是ifort10打完最新的补丁就可以了，上面还像模像样的给除了一个用ictce编译vasp的例子，不过我没试。
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10楼2008-08-03 00:53:48
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