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swordzj858

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】Autodock4中进行Grid时的问题

请教各位高手,我在用Autodock4.0进行对接时,前面进行比较顺利,当进行到准备marcomolecule时,进行如下操作:Grid——Macromolecule——choose——select molecule,但是当我选中蛋白质的编号时,出现了Warning: initializing 1Y6A.pdb的警告,然后是Warning:AutoGrid requires written pdbqt molecule!的警告。
请教各位高手是怎么回事?不胜感激!
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★ ★ ★
swordzj858(金币+2,VIP+0):Thanks
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
在autodock4中受体与配体的文件格式都已变成了pdbqt的格式,不要再使用pdbqs的那种autodock3的格式了。
另外,在autodock4中溶剂化参数已经集成于参数文件中,不需要再另外添加
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
4楼2008-07-28 11:32:16
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