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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
丫丫兮兮1991: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-06-18 21:03:47
1、首先应该分别优化形成氢键的双方，再拼在一起算氢键。不要把单个优化的问题带到大体系中。
2、b3lyp不能算弱相互作用，不能用来算氢键，但体系如此之大，要用DFT-D才有可能。DFT-D在G09 D版才有。
3、不要一开始就想算 freq，算完opt再说。 freq需要更大的计算量和存储空间。
4、拼接时优先考虑O。最好同时考虑多个。可以分别画出二者的静电势图帮助选择拼接点。
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丫丫兮兮1991
11楼2015-06-18 08:59:32
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丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)
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10楼: Originally posted by kong890109 at 2015-06-18 08:49:48
C                  4.81015400   -2.57142100   -1.71779900
H                  5.59885400   -2.18129200   -1.03773000
H                  5.33150000   -2.85150500   -2.65976100
C                   ...

但我算了3个多小时后它还是以L502错误收尾，不管我是用bl3yp-6-31+g*算还是sto-3g,最后都不能成功结束。
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12楼2015-06-18 18:14:19
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丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)
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10楼: Originally posted by kong890109 at 2015-06-18 08:49:48
C                  4.81015400   -2.57142100   -1.71779900
H                  5.59885400   -2.18129200   -1.03773000
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C                   ...

不知道能不能加你Q，我的Q:278849834
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13楼2015-06-18 18:15:41
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10楼: Originally posted by kong890109 at 2015-06-18 08:49:48
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H                  5.59885400   -2.18129200   -1.03773000
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C                   ...

不知道能不能加你Q聊，我Q:278849834
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14楼2015-06-18 21:02:04
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丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
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11楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-06-18 08:59:32
1、首先应该分别优化形成氢键的双方，再拼在一起算氢键。不要把单个优化的问题带到大体系中。
2、b3lyp不能算弱相互作用，不能用来算氢键，但体系如此之大，要用DFT-D才有可能。DFT-D在G09 D版才有。
3、不要一开 ...

1.我先优化各个分子，在进行氢键体系优化
2.我看别人有用b3lyp算氢键的，他们都算成功了，不知道为什么这个方法不行？不行的话为什么他们可以算成功呢？
3.这个应该很有用，我马上试试
4.由于我高斯刚刚开始学习计算，不知道怎么画静电势图，可不可以教教我，感激不尽！！！
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15楼2015-06-18 21:08:50
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丫丫兮兮1991

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
11楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-06-18 08:59:32
1、首先应该分别优化形成氢键的双方，再拼在一起算氢键。不要把单个优化的问题带到大体系中。
2、b3lyp不能算弱相互作用，不能用来算氢键，但体系如此之大，要用DFT-D才有可能。DFT-D在G09 D版才有。
3、不要一开 ...

再问一下，我用DS软件找氢键位置跟你说的画出静电势图找氢键位置哪个更准确点？
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16楼2015-06-18 21:33:21
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