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王小燕30

铜虫 (小有名气)

[求助] 跑出来的PCR结果一直是这样的,不知各位大虾可否指点指点,多谢多谢已有11人参与

应该跑出目的条带的,可是一直是拖尾,从加样孔就开始拖。。。。怎么办,是什么问题呢希望各位大哥大姐路过的看过的给指点指点哦

跑出来的PCR结果一直是这样的,不知各位大虾可否指点指点,多谢多谢
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跑出来的PCR结果一直是这样的,不知各位大虾可否指点指点,多谢多谢-1
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跑出来的PCR结果一直是这样的,不知各位大虾可否指点指点,多谢多谢-2
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-06-19 20:46:15
你的模板是12000-13000bp,还有人让你用2%的胶,2%的胶只能分离50-2000bp的模板,兼职是笑话,正确的胶浓度应该是0.5%,还有你的模板较长,普通的Taq 酶很难扩增,一般的酶最多只能扩增5kb以下,热启动酶不过才能扩增10kb,所以你要用专为长片段扩增生产的酶 LA Taq酶扩增,还有,看你的图,模板应该是有问题的,竟然从头拖到尾,也很怪异了,还是重新考虑下模板,而且注意上样量,模板,酶上样量过多也会产生这种效果,引物次要考虑吧,只是出来条带在考虑,

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
24楼2015-06-18 10:03:51
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请提供反应体系和程序。让大家参考参考
2楼2015-06-16 20:19:10
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mangool

新虫 (初入文坛)

有可能是提取核酸的纯度不好
3楼2015-06-16 20:33:08
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王小燕30

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-06-16 20:19:10
请提供反应体系和程序。让大家参考参考

我做的是长距离PCR,要跑出的条带是12000和11000,就是应该是电泳图上最上边两条marker之间的条带。一直是拖尾。
三条引物是:(上游引物)P:5’一GCC CTG CCT GTC CAT TAC ACT GAT GAC ATT ATG CTG AC-3’
(下游引物)Q:5'-GGC CCT ACA ACC ATT CTG CCT TTC ACT TTC AGT GCA ATA-3’
(下游引物)B:5’-CCC CAA ACT ATA ACC AGC ACC TTG AAC TTC CCC TCT CATA-3’;
反应体系:引物P、Q、B(20 pmol/ul)分别2ul、1ul、1ul,模板基因组DNA 2ul(约100 ng),TaKaRa LA Taq酶0.25ul(5 U/ul),2×GC缓冲液I 12.5ul,dNTP 4ul,蒸馏水补足,总反应体积25ul。
反应条件:94℃预变性2 min,前10个循环98℃变性10 s,68℃退火/延伸10 min,后20个循环98℃变性10 s,68℃延伸10 min 20s,共进行30个循环。电泳:配制6g/L琼脂糖凝胶,PCR产物5ul与6×上样缓冲液1ul混匀上样,在恒压75 V电泳,成像
我就是想问问这样拖带可能跟什么关系最大



我做的时候就一直在变化引物浓度比例,和退火温度。用梯度PCR仪做过,退火温度从65、66、-69、70,也没什么明显的结果条带哦
4楼2015-06-16 21:55:43
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