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王小燕30

铜虫 (小有名气)

[求助] 跑出来的PCR结果一直是这样的,不知各位大虾可否指点指点,多谢多谢 已有11人参与

应该跑出目的条带的,可是一直是拖尾,从加样孔就开始拖。。。。怎么办,是什么问题呢希望各位大哥大姐路过的看过的给指点指点哦

跑出来的PCR结果一直是这样的,不知各位大虾可否指点指点,多谢多谢
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跑出来的PCR结果一直是这样的,不知各位大虾可否指点指点,多谢多谢-1
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跑出来的PCR结果一直是这样的,不知各位大虾可否指点指点,多谢多谢-2
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-06-17 22:50:17
这个图。。。。。。。太壮观了,倚天出鞘啊!
言归正传。你这个应该是胶的问题,即使PCR失败或者模板有问题也不应该是这种情况;建议按如下步骤排查:
1、直接用模板DNA跑电泳或者其他正常扩增的小片段PCR产物(小于2000 bp)跑电泳(可以在同一块胶上加你的长片段PCR产物),如果所有泳道均是上述情况,那么你的胶有问题了。可能原因:胶里面混有大量杂质DNA、胶配制有问题、冷凝时间太短等等。
2、PCR可能的问题,如果操作、试剂和程序没有问题,就是引物特异性太差,导致产物大小不等,不过这个几率非常小。

胶的问题可能性比较大。
没有做不到,只有想不到!
20楼2015-06-17 22:27:18
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请提供反应体系和程序。让大家参考参考
2楼2015-06-16 20:19:10
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mangool

新虫 (初入文坛)

有可能是提取核酸的纯度不好
3楼2015-06-16 20:33:08
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王小燕30

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-06-16 20:19:10
请提供反应体系和程序。让大家参考参考

我做的是长距离PCR,要跑出的条带是12000和11000,就是应该是电泳图上最上边两条marker之间的条带。一直是拖尾。
三条引物是:(上游引物)P:5’一GCC CTG CCT GTC CAT TAC ACT GAT GAC ATT ATG CTG AC-3’
(下游引物)Q:5'-GGC CCT ACA ACC ATT CTG CCT TTC ACT TTC AGT GCA ATA-3’
(下游引物)B:5’-CCC CAA ACT ATA ACC AGC ACC TTG AAC TTC CCC TCT CATA-3’;
反应体系:引物P、Q、B(20 pmol/ul)分别2ul、1ul、1ul,模板基因组DNA 2ul(约100 ng),TaKaRa LA Taq酶0.25ul(5 U/ul),2×GC缓冲液I 12.5ul,dNTP 4ul,蒸馏水补足,总反应体积25ul。
反应条件:94℃预变性2 min,前10个循环98℃变性10 s,68℃退火/延伸10 min,后20个循环98℃变性10 s,68℃延伸10 min 20s,共进行30个循环。电泳:配制6g/L琼脂糖凝胶,PCR产物5ul与6×上样缓冲液1ul混匀上样,在恒压75 V电泳,成像
我就是想问问这样拖带可能跟什么关系最大



我做的时候就一直在变化引物浓度比例,和退火温度。用梯度PCR仪做过,退火温度从65、66、-69、70,也没什么明显的结果条带哦
4楼2015-06-16 21:55:43
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