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汕头大学海洋科学接受调剂
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378287892

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Dmol3和castep计算能量问题

麻烦问一下,用castep和Dmol3计算同一个体系能量差别应该很大吗?我计算的差7倍,正常吗?请高手指点

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:24 ]
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awpsr

金虫 (正式写手)

快快乐乐小青虫

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):3q
DMol3和CASTEP计算能量不会差很多,关键是函数的选取,对能量影响最大的是函数,而不是精度,你要保证这两种算法采取相同的函数。结果相差7倍是不正常的。
世上本没有人, 路走多了便成了人
2楼2008-07-26 11:57:48
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acridine

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
csfn(金币+4,VIP+0):正解
楼主是指"总能量"吗?
如果是比较"相对能量"值,如结合能,掺杂能,或者表面能,结果虽然一定是有差别的,但是如楼上所说,绝不会相差那么大的.
如果是比较总能量就有可能了,比较两个不同方法得到的总能量也是没什么意义的,尤其是dmol一般都用全电子,包含内层电子的能量,而castep的总能量就没有这个部分,因此算一些序数比较大的原子时能量差别会特别的大.

[ Last edited by acridine on 2008-7-26 at 16:11 ]
3楼2008-07-26 16:10:05
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378287892

金虫 (小有名气)

谢谢上面的回答,我说的是总能量,后来我也计算了一下相对能量,也有点差别,,但不是很大;

另外我还有一个问题,就是我在算纳米管储氢的吸附能,但是文献上公布的碳纳米管的吸附能一般在80-100meV之间,而我用castep计算的总是在几百meV,哪怕是采取的函数,切断能等参数和文献一样,计算的能量也是偏大,我现在就怀疑我的建模有问题,一般情况下,H在CNTs上有几种吸附位,不知道这几种吸附位是怎么建立的,楼上的如果懂的话,麻烦告知,非常感谢!
4楼2008-07-27 09:35:35
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awpsr

金虫 (正式写手)

快快乐乐小青虫

★ ★ ★
csfn(金币+3,VIP+0):3Q
吸附位也是试出来的,你可以通过结构优化,或者直接用单点能计算能量。计算完就将吸附的分子移动下位置,包括上下、左右和角度。一点点试,最后可做个势能曲线出来。
世上本没有人, 路走多了便成了人
5楼2008-07-27 10:13:29
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philonb

银虫 (小有名气)


csfn(金币+1,VIP+0):3q
如果如楼主说是总能量的话就不对了
楼主看看取的体系是不是一样,原子数不同的话能量肯定是不一样的
6楼2008-07-27 10:54:15
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378287892

金虫 (小有名气)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
吸附位也是试出来的,你可以通过结构优化,或者直接用单点能计算能量。计算完就将吸附的分子移动下位置,包括上下、左右和角度。一点点试,最后可做个势能曲线出来。

谢谢您的答复,感觉说得有道理,但是一点点试岂不是很浪费时间?你也是做吸附的吗?
7楼2008-07-27 17:40:52
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awpsr

金虫 (正式写手)

快快乐乐小青虫

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
看电脑的性能了,有时候分子多的时候做结构优化是很费时间的,所以在电脑性能不好的时候进行单点能计算,找到合适的位置再进行结构优化,其实很快就会找到的。如果电脑性能达到要求的话,最好是做动力学模拟,可以看到吸附的结果和中间过程,其中有好几个过渡态。不过动力学是相当费时的,8个CPU以上可以尝试下。
世上本没有人, 路走多了便成了人
8楼2008-07-28 08:46:13
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378287892

金虫 (小有名气)

非常感谢awpsr的仔细答复,我考虑了一下,我觉得你这个路比较可行,我已经开始尝试这样做了,由于电脑是实验室配的一般电脑,没有服务器,所以有点慢,慢慢来吧,再次感谢!
9楼2008-07-28 14:43:59
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