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yijun0516

铜虫 (小有名气)

[交流] 动力学运算出大问题了

单机进行NPT动力学运算时,温度不受控制,那位大侠给指导一下,究竟是怎么回事啊?拜谢!
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saitou

木虫 (正式写手)

跑了多久?
体系能量变化怎样?
具体情况还有待说明
不抛弃,不放弃
2楼2008-07-26 02:17:18
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renwenpo

金虫 (小有名气)

我也运到这种情况,温度一直上升,从小于目标温度上升到大于目标温度,不受控制...
3楼2008-07-26 09:30:48
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yijun0516

铜虫 (小有名气)

我先跑了50ps,有问发现题后,又跑了2nm,结果温度还是失控。我做的高分子体系,力场选用COMPASS,non-bond采用atom based,温度控制和压力控制分别采用Andersen和Berendsen方法控制,计算出来的能量相差有2000左右。
今天我换了group-based来计算,暂时还没有发现问题。请问温度造成温度失控的影响因素有哪些?请高手再指点一二!
4楼2008-07-26 21:43:46
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