24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
查看: 1067  |  回复: 1

foclnbrsic

铜虫 (初入文坛)

[求助] gaussian09计算1-丁基-3-甲基咪唑阳离子电荷布居的问题

大家好,本人是量化新手,最近学习用gaussian09进行计算,在计算1-丁基-3-甲基咪唑阳离子的电荷布居时遇到了一些问题,想向大家请教一下。
我用了两种方法,第一种是NBO,输入文件和结果如下:
%nprocshared=8
%chk=bmim.chk
%mem=1000MW
# opt=tight b3lyp/6-311++g(d,p) pop=nbo sp test

bmim

1 1
C                  2.36134200   -0.30291700    0.56377200
C                  1.10194200   -0.62271700    0.14137200
N                  0.33804200    0.51268300    0.30847200
C                  1.07744200    1.50548300    0.81267200
N                  2.31024200    1.01358300    0.96987200
C                  3.47578200    1.78626400    1.51253000
C                 -1.09057000    0.61694700   -0.02182900
C                 -1.58383800   -0.71504400   -0.57138800
C                 -3.06395700   -0.60702100   -0.91359800
C                 -3.55722600   -1.93901200   -1.46315700
H                  3.24051300   -0.96388600    0.57715300
H                  0.76480600   -1.59256200   -0.25326800
H                  0.73875000    2.52458100    1.05084700
H                  4.37683100    1.13325600    1.53399800
H                  3.67201000    2.66702900    0.86098100
H                  3.24345300    2.13166700    2.54475600
H                 -1.66513700    0.87466900    0.89589700
H                 -1.23711500    1.41118600   -0.78764700
H                 -1.00927100   -0.97276700   -1.48911400
H                 -1.43729300   -1.50928400    0.19443000
H                 -3.63852400   -0.34929800    0.00412800
H                 -3.21050300    0.18721900   -1.67941500
H                 -4.63888900   -1.86006900   -1.71324200
H                 -2.98265900   -2.19673500   -2.38088300
H                 -3.41068000   -2.73325200   -0.69733900

1 2 2.0 5 1.5 11 1.0
2 3 1.5 12 1.0
3 4 1.5 7 1.0
4 5 1.5 13 1.0
5 6 1.0
6 14 1.0 15 1.0 16 1.0
7 8 1.0 17 1.0 18 1.0
8 9 1.0 19 1.0 20 1.0
9 10 1.0 21 1.0 22 1.0
10 23 1.0 24 1.0 25 1.0
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
——————————————————下面是结果
                                       Natural Population
                Natural  -----------------------------------------------
    Atom  No    Charge         Core      Valence    Rydberg      Total
-----------------------------------------------------------------------
      C    1   -0.15060      1.99911     4.13301    0.01848     6.15060
      C    2   -0.15109      1.99913     4.13376    0.01820     6.15109
      N    3   -0.25333      1.99926     5.23878    0.01529     7.25333
      C    4    0.33509      1.99915     3.64526    0.02050     5.66491
      N    5   -0.24413      1.99926     5.23166    0.01322     7.24413
      C    6   -0.60923      1.99924     4.59923    0.01076     6.60923
      C    7   -0.30384      1.99919     4.28929    0.01536     6.30384
      C    8   -0.64776      1.99923     4.63549    0.01304     6.64776
      C    9   -0.60424      1.99925     4.59313    0.01185     6.60424
      C   10   -0.92808      1.99929     4.91998    0.00881     6.92808
      H   11    0.31324      0.00000     0.68532    0.00143     0.68676
      H   12    0.31641      0.00000     0.68199    0.00160     0.68359
      H   13    0.29205      0.00000     0.70654    0.00141     0.70795
      H   14    0.29814      0.00000     0.70066    0.00120     0.70186
      H   15    0.29119      0.00000     0.70754    0.00127     0.70881
      H   16    0.29121      0.00000     0.70752    0.00127     0.70879
      H   17    0.29077      0.00000     0.70733    0.00190     0.70923
      H   18    0.29082      0.00000     0.70729    0.00190     0.70918
      H   19    0.31321      0.00000     0.68473    0.00206     0.68679
      H   20    0.31326      0.00000     0.68468    0.00206     0.68674
      H   21    0.30551      0.00000     0.69256    0.00194     0.69449
      H   22    0.30556      0.00000     0.69251    0.00193     0.69444
      H   23    0.31523      0.00000     0.68345    0.00132     0.68477
      H   24    0.31029      0.00000     0.68817    0.00155     0.68971
      H   25    0.31032      0.00000     0.68813    0.00155     0.68968
————————————————————
第二种是Mulliken,输入文件没有pop=nbo,其他相同,结果是:
Mulliken atomic charges:
              1
     1  C   -0.373840
     2  C    0.022657
     3  N    0.139338
     4  C    0.094221
     5  N    0.136618
     6  C   -0.507527
     7  C   -0.530899
     8  C   -0.208323
     9  C   -0.777532
    10  C   -1.008057
    11  H    0.263268
    12  H    0.261924
    13  H    0.232876
    14  H    0.249825
    15  H    0.266894
    16  H    0.266870
    17  H    0.289971
    18  H    0.289918
    19  H    0.283122
    20  H    0.283093
    21  H    0.262814
    22  H    0.262852
    23  H    0.279577
    24  H    0.260174
    25  H    0.260165
我的问题是
1)输入文件中的sp test是什么意思?我在gaussian的文档中没有找到test关键词。(输入文件是我用chem3d保存构型为gjf后,用gaussview载入的。setup选的是opt,tight,b3lyp和6-311++g(d,p)。gaussview自动在下边添加了Additional Keywords:sp test。我试过如果没有这两个关键词,程序无法运行);
2)两种方法算出来的电荷布居为何与直观感觉相差很大?应该是咪唑环上正点强,氢上接近中性才比较符合直觉啊。而计算出来咪唑环是带负电的。相比之下, 我用Material Studio计算的Mulliken布居比较“正常”(同为b3lyp)。是不是我基组和方法选择的问题呢?
谢谢大家!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凡士林护手霜

铜虫 (正式写手)

你好,请问你是做量子化学计算的研究吗,你们单位购买了吗
梦想在心中,路在脚下。
2楼2016-04-26 13:49:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 foclnbrsic 的主题更新
信息提示
请填处理意见