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小虫_sang

铁虫 (正式写手)

[求助] 气体在石墨烯空隙中扩散动力学模拟报错、失败

问题如图:

气体在石墨烯空隙中扩散动力学模拟报错、失败
问题描述.png


气体在石墨烯空隙中扩散动力学模拟报错、失败-1
能量、温度曲线.png
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小虫_sang

铁虫 (正式写手)

本帖的问题是这样的:我想模拟CH4分子在石墨烯孔道中的扩散问题,我是这样做的:1.构建石墨烯孔道结构并优化;2.构建一定密度的CH4气体盒子并优化;3.通过“Built Layers”构建Layers结构,并优化;4.跑动力学(NVT、298K、步长1fs、时间10000ps、Andersen控温)
但是在跑到产不多一半的时候就报错,提示能量偏差超过设定值。并且能量和温度曲线呈现上升趋势(如楼上曲线,明显错误了)。并且同样的模型在其他密度下(气体盒子中CH4密度不同)都成功计算了,只有在这个密度下的计算失败了
还望有经验的虫友帮忙分析一下,谢谢~~
2楼2015-06-10 15:25:41
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