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hoistsjq

[交流] 【求助】Minimizer出错(Discover)

discover做minimizer时出错:
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C9(c3a)-N1(n2z)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: O3(o2)-Na1(na_o)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: O5(o2)-Na2(na_o)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: N1(n2z)-N2(n2z)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C11(c3a)-N2(n2z)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: O8(o2)-Na3(na_o)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: O11(o2)-Na4(na_o)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: O17(o2)-Na5(na_o)
 请问如何解决?
[search]minimizer时出错[/search]

[ Last edited by zzgyb on 2008-7-24 at 11:56 ]
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truemantwo

木虫 (正式写手)

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
选用的力场不对。
换COMPASS力场试试
2楼2008-07-24 09:45:54
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
Discover对金属原子的支持不好,默认的CVFF力场中是有NA原子的,但就是赋不上值不能算,这个我以前也这样,包括MG,Ca 都这样
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
3楼2008-07-24 09:54:06
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wobuzhidao1

金虫 (小有名气)

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
这个问题我也碰见过,如NH4CLO4这个物质,也是因为力场开发系统没有,你这个问题也一样,估计只能换力场,要不就是采用DMOL或者castep了进行从头算
4楼2008-07-27 08:47:13
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hoistsjq

我用的是compass力场
换了其它力场也不行
看来只用其它模块试试了
多谢三位!
5楼2008-07-28 09:00:01
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fspdlh

金虫 (正式写手)

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
自己定义力场类型,我也遇到过类似问题,比如磷酸根的O默认是O1-,会报错,改为O2c就可以了
6楼2008-07-30 19:26:20
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super7

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2008-7-24 09:54:
Discover对金属原子的支持不好,默认的CVFF力场中是有NA原子的,但就是赋不上值不能算,这个我以前也这样,包括MG,Ca 都这样

请问一下,这种情况下如何处理好?例如我要计算的是CaCO3和Fe2O3,也是计算一般的时候就进行不下去了。
7楼2008-07-31 15:49:56
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
对不起,起码我现在尚认为对discover来说,无解,也可能还没找到方法
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
8楼2008-07-31 16:17:59
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