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Gaoxiguang

木虫 (正式写手)


[资源] Win7 64位下安装Lammps和MPICH实现单机并行计算20150602(原创)

见附件。
自己总结的Win7 64位下安装Lammps和MPICH实现单机并行计算的方法。
对老鸟没啥用。对新手还有一定借鉴意义的。
有不合适的地方欢迎指正!!!我把文字贴出来,要看图片的直接下载附件!

Win7 64位下安装Lammps和MPICH实现单机并行计算20150602(龙门镖局)
让学生搞了半年Lammps,居然说win7 64位不能安装。现在有时间,索性自己来搞定。经过一天的努力,终于实现win7 64位下使用Lammps,并实现MPICH单机下的并行计算。注意:不使用任何虚拟机。
一、        Lammpus软件下载和安装
进入Lammpus官方网站下载:http://lammps.sandia.gov/download.html

直接点击倒数第二个链接“windows installer package”下载安装包。

点击页面下方,“Latest version for 64-bit Windows”下载最新的版本。下载后大约48.6M,点击安装包,安装。
二、        Lammpus软件测试
安装完后到安装目录下,能找到一个bin文件夹。Lammps的可执行文件就在这个文件夹下。
对于初学者,我们一般只调用两个exe文件,一个是lmp_serial.exe,这个文件适用于非并行计算的。另一个是lmp_mpi.exe,这个在MPICH配合下可以实现单机多线程计算和多机分布式计算。
先用lmp_serial.exe来测试安装的程序是否可用。我用example/crack/in.crack文件来测试。lammps的输入文件都命名为in.xxx。
打开windows命令窗口,可以在windos开始菜单中的运行窗口输入cmd打开。
然后在cmd窗口用cd命令(cd命令是dos命令)进入lammps的bin文件夹。在cmd窗口中输入lmp_serial –in in.crack回车,开始计算。

计算完的窗口如下图所示。

说明安装是没问题的。计算时间是15s,用了4个线程。不知道这里4个线程指的啥。我是I5的cpu,计算时看cpu使用不到50%。根据http://rpm.lammps.org/windows.html的提示可以在命令行通过set OMP_NUM_THREADS=n(这里n表示线程数)来设置多线程运算。但是经过试验,不论n=1,4,还是8,计算时间都等于15s。
三、        下载MPICH
MPICH软件可以到网关下载:http://www.mpich.org/。但是要注意,MPICH其实即包含了用于并行计算编程的sdk资源,也包含了可行文件。我们这里只用到MPICH的可执行文件。打开http://www.mpich.org/后最新版本的都是用于编程的sdk资源。这目前对我们来说没有用,我们要找可执行文件。
因此我们在页面中找“Older releases are available here”.点击这个here下载之前的版本。点击here后进入http://www.mpich.org/static/downloads/页面。
截至到发稿时间,只有1.4版本的提供windows 64位的MPICH可执行文件。下载mpich2-1.4-win-x86-64.msi并安装。安装成功后进入下一步。


四、        配置MPICH并运行
安装成功后,在MPICH2\bin文件夹下可以找到smpd.exe和mpiexec.exe连个文件。为了方便后面使用,把这两个文件拷贝到lammps的bin文件夹下。
先右键点击smpd.exe,点击属性,设置为管理员权限。然后在cmd窗口中输入smpd –install。安装MPICH2服务。如果没有安装成功,后面运行mpiexec的时候会出现“由于服务器的积极拒绝”之类的错误。有的帖子说要运行smpd -install -phrase beHappy来注册,不知道和smpd –install命令是否等价。总之两个命令我都运行了。最关键的步骤就是要把smpd的属性设定为管理员权限。
然后在win7控制面板里创建一个MPI的管理员帐户,密码也设定为MPI。
运行mpiexec.exe –register注册账户。这里的账户名称和密码就是刚才创建的,都是MPI。
然后在cmd窗口输入mpiexec -n 2 lmp_mpi -in in.crack命令。一会功夫就计算出来了,系统提示耗时10s。证明并行起了成效。
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  • 附件 1 : Win7_64位下安装Lammps和MPICH实现单机并行计算20150602.pdf
  • 2015-06-03 07:14:40, 477.97 K

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李加伟

荣誉版主 (文坛精英)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

引用回帖:
49楼: Originally posted by 维特的日记 at 2015-10-24 23:48:26
需要这么麻烦吗 我是直接安装完mpich后把mpiexec拷贝到lammps下的bin里就可以用了 只是他提示openmpi environment variable is not set之类的 但是不影响并行计算 而且不需要设置什么mpi管理员密码啥的
...

你好,请问这个 environment variable is not set一般是因为什么原因引起的呢,我算的时候也有这个警告
133楼2016-12-28 22:52:38
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查看全部 169 个回答

xianlaoshi

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢,如有操作文本多好
2楼2015-06-03 14:05:17
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hakuna

木虫 (知名作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

虽然不玩这个,还是鼓励这种钻研精神,顶一下,感谢分享!
3楼2015-06-03 17:42:18
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Gaoxiguang

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by xianlaoshi at 2015-06-03 14:05:17
非常感谢,如有操作文本多好

请问,什么叫操作文本?
5楼2015-06-04 01:16:20
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简单回复
2015-06-03 23:19   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
yujingui7楼
2015-06-04 12:58   回复  
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2015-06-05 20:25   回复  
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ss6139楼
2015-06-06 00:20   回复  
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wmnick12楼
2015-06-08 07:07   回复  
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gongxd32513楼
2015-06-08 11:38   回复  
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yuanbing14楼
2015-06-08 11:51   回复  
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