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xingyun5182

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】Autodock生成dlg转换成pdb后,如何将其中不同构型分开。

我在autodock的问题集中看到了这段命令:
    set a=`grep ENDMDL my_docking.pdb | wc -l`
    set b=`expr $a - 2`
    csplit -k -s -n 3 -f my_docking. mydocking.pdb '/^ENDMDL/+1' '{'$b'}'
    foreach f ( mydocking.[0-9][0-9][0-9] )
      mv $f $f.pdb
    end
但我输入后没有反应,也没有产生多个pdb文件,怎么回事呢?

还有一个问题就是Autodock4的受体也有构型上的变化,怎么在最后产生的对接复合物的pdb文件中将受体和配体的构型变化都体现出来呢?

谢谢!!!
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