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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Sugar7766

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] 【整画风!!!】HSA的结构图,看到文献里用SPDBV,但是我弄出来的... 已有1人参与

需要做一个HSA的结构图,看到人家文献里用SPDBV,然后我就去下了一个SPDBV-4.10,在Protein data bank里找了一个HSA Ligand Free.pdb的文件,导到软件里面就不大对劲了,见附图。这个pdb文件是自己写出来了么?反正就是各种不懂。
       之前没有接触过这方面的知识,不知道我描述清楚了木有,希望各位大神可以帮忙看看。拜谢!!【整画风!!!】HSA的结构图,看到文献里用SPDBV,但是我弄出来的...
360桌面截图20150529125634.jpg
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  • 附件 1 : 4K2C(HSA_Ligand_Free).pdb
  • 2015-05-29 13:14:57, 1.47 M

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ckm840529

管理员

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【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Sugar7766: 金币+2, 有帮助 2015-05-30 00:26:44
PDB文件不会错。问题在于一是你的软件观察角度不对,需要旋转,二是你需要设置蛋白显示的结构,人家的图是按照二级结构并配色实现的,你的图看着只是一级结构配色。
行胜于言!科学求真,社会求善,艺术求美!
2楼2015-05-29 15:16:50
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Sugar7766

专家顾问

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引用回帖:
2楼: Originally posted by ckm840529 at 2015-05-29 15:16:50
PDB文件不会错。问题在于一是你的软件观察角度不对,需要旋转,二是你需要设置蛋白显示的结构,人家的图是按照二级结构并配色实现的,你的图看着只是一级结构配色。

首先谢谢您的回复~
我之后又去弄了一个汉化版的Swiss-PdbViewer 3.7。
我的图选的是【颜色-用于二级结构衍生】
您说的两点,第一点的意思是鼠标拖动改变观察角度么?
第二点,在Swiss-PdbViewer 3.7上具体要怎么操作咧?
求指教~~~~先谢谢!!!!

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  • 附件 1 : Swiss-PdbViewer_3.7.rar
  • 2015-05-30 10:04:59, 644.54 K
3楼2015-05-30 10:06:35
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ckm840529

实习版主

I love science!

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
Sugar7766: 金币+4, ★★★★★最佳答案 2015-06-01 21:01:54
引用回帖:
3楼: Originally posted by Sugar7766 at 2015-05-30 10:06:35
首先谢谢您的回复~
我之后又去弄了一个汉化版的Swiss-PdbViewer 3.7。
我的图选的是【颜色-用于二级结构衍生】
您说的两点,第一点的意思是鼠标拖动改变观察角度么?
第二点,在Swiss-PdbViewer 3.7上具体要怎 ...

你说的软件我没有用过,具体操作我不会。但我使用过pymol,Chimera等软件。蛋白结构显示软件都是会有视图改变和结构显示操作的,具体你可以再研究下软件。帮不上具体的忙,抱歉。
行胜于言!科学求真,社会求善,艺术求美!
4楼2015-06-01 09:00:27
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Sugar7766

超级版主

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引用回帖:
4楼: Originally posted by ckm840529 at 2015-06-01 09:00:27
你说的软件我没有用过,具体操作我不会。但我使用过pymol,Chimera等软件。蛋白结构显示软件都是会有视图改变和结构显示操作的,具体你可以再研究下软件。帮不上具体的忙,抱歉。...

恩恩,谢谢你啦。我的老师说我最近不用看这方面的啦~
5楼2015-06-01 21:03:35
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