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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 关于SILVA数据库及miseq测序，求助
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古木天恕

木虫 (正式写手)

[求助] 关于SILVA数据库及miseq测序，求助

做了个miseq测序，用的是SILVA数据库比对的，大家有了解这个数据库的么，
对miseq测序大家也聊一聊呗
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1楼 2015-05-26 17:47:51
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liuchi0426

金虫 (小有名气)
SILVA数据库是基于RDP中的数据建的，分类比greengenes要更详细，更新也相对快些，别的就无所谓了
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Iamthebest!
2楼2015-05-27 19:34:53
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古木天恕

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuchi0426 at 2015-05-27 19:34:53
SILVA数据库是基于RDP中的数据建的，分类比greengenes要更详细，更新也相对快些，别的就无所谓了

哦，谢谢，那数据方面应该比较全面和准确吧？
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3楼2015-05-28 10:55:24
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liuchi0426

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 古木天恕 at 2015-05-28 10:55:24
哦，谢谢，那数据方面应该比较全面和准确吧？...

差不多吧，稍微准确点，如果偏重于微生物，最好用SILVA或者用在线的RDP，如果倾向于生态学问题，用哪个都一样
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Iamthebest!
4楼2015-05-28 21:24:00
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