应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » HyperChem/NWChem » ubuntu14.04编译Nwchem6.5步骤（亲测成功）
51/1返回列表
查看: 1650  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【奖励】 本帖被评价2次，作者Mikasa_zly增加金币 1.6 个
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Mikasa_zly

木虫 (正式写手)

[资源] ubuntu14.04编译Nwchem6.5步骤（亲测成功） 已有1人参与

1. 安装ifort 12.1.0到默认路径（其它版本我没试过）。
Intel Parallel Studio XE for Linux 2011 密钥 L3FN-2VRGKX7K
2. 使用ifort
进入/opt/intel/目录，
执行source bin/compilervars.sh intel64命令，设置环境变量，该脚本设置了如下环境变量：
LD_LIBRARY_PATH  运行时需要
LIBRARY_PATH   编译时连接时需要
NLSPATH
MANPATH
INCLUDE
FPATH
CPATH
PATH
LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/compos
er_xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_
2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/debugger/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mpirt/lib/intel64
IBRARY_PATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_
xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/lib/intel64
LSPATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64/locale/%l_%t/
%N:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/lib/intel64/locale/%l_%t/
%N:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/debugger/intel64/locale/%l_%t/%N
ANPATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/man/en_US:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.3
19/man/en_US:/development/gcc-
4.3.0/man:/local/zkl/mpich2/man:/opt/jdk1.6.0_20/man:/usr/share/man/zh_CN:/usr/share/man:/usr/kerberos/man:/usr/local/share/man:/usr/X11R6/man:/usr/m
an:/usr/local/man:
INCLUDE=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/include
FPATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/include
CPATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/include
PATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/bin/intel64:*****
3. 安装编译openmpi
去http://www.open-mpi.org下载OpenMPI 1.6.5（更新的版本大抵也可以，笔者没测试），解压到/sob目录下，进入其目录，运行
./configure FC=ifort F77=ifort prefix=/home/zly/openmpi165
make all install –j
此时openmpi的可执行文件、库文件、头文件等就被装到了/home/zly/openmpi165里面的对应目录下。
设置环境变量(sudo gedit ~/.bashrc)，在.bashrc中加入
export PATH=$PATH: /home/zly/openmpi165/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH: /home/zly/openmpi165/lib
输入(source ~/.bashrc)使环境变量生效。
4. 编译Nwchem6.5
1) 设置环境变量将Nwchem6.5解压到/home/zly/Nwchem-6.5，运行
export NWCHEM_TOP=/home/zly/nwchem-releases/nwchem-6.5
export NWCHEM_TARGET=LINUX64
export NWCHEM_MODULES="all python"
export MPI_INCLUDE=/home/zly/openmpi165/include
export MPI_LIB=/home/zly/openmpi165/lib
export LIBMPI="-lmpi_f90 -lmpi_f77 -lmpi -ldl -Wl,--export-dynamic -lnsl -luti "
export FC=gfortran
export CC=fcc
export CXX=g++
#export ARMCI_NETWORK=MPI-MT
#export MSG_COMMS=MPI
#export BLASOPT=" "
export PYTHON_EXE=/usr/bin/python
export PYTHONVERSION=2.7
export USE_PYTHON64=yes
export PYTHONPATH=/usr/local/lib/python2.7/site-packages
export PYTHONHOME=/usr
export PYTHONLIBTYPE=a
function renwc()
{
   make FC=$FC ; pushd $NWCHEM_TOP/src ; make FC=$FC link ; popd
}
2) 编译
cd /sob/Nwchem-6.5/src
make nwchem_config
make
3) 可执行文件生成在了/nwchem-6.5/bin/LINUX64下，把它加入PATH环境变量即可。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

NWCHEM

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

WanderingHeart

» 猜你喜欢
1楼 2015-05-21 22:00:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Mikasa_zly

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by WanderingHeart at 2015-05-21 22:57:32
赞分享！

谢谢～
回复此楼
3楼2015-05-22 08:52:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

qchem

铁杆木虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

能否打包成deb分享呀
我系统也是14.04

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2015-05-24 17:42:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Mikasa_zly

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by qchem at 2015-05-24 17:42:10
能否打包成deb分享呀
我系统也是14.04

我直接编译的源文件…现在还不会打包deb呢
赞一下 回复此楼
6楼2015-05-26 13:03:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 可靠消息，8月21号(明天)放榜 +11 医学老男孩 2026-08-20 13/650 2026-08-20 10:50 by anjeeshine
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 21/1050 2026-08-20 10:37 by Vivilian
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +15 Ldrop2023 2026-08-13 19/950 2026-08-20 10:30 by 陈晨晨陈啊
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 125/6250 2026-08-20 09:02 by 医学老男孩
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖？ +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭