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ubuntu14.04编译Nwchem6.5步骤（亲测成功） 已有1人参与
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1. 安装ifort 12.1.0到默认路径（其它版本我没试过）。 Intel Parallel Studio XE for Linux 2011 密钥 L3FN-2VRGKX7K 2. 使用ifort 进入/opt/intel/目录， 执行source bin/compilervars.sh intel64命令，设置环境变量，该脚本设置了如下环境变量： LD_LIBRARY_PATH 运行时需要 LIBRARY_PATH 编译时连接时需要 NLSPATH MANPATH INCLUDE FPATH CPATH PATH LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/compos er_xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_ 2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/debugger/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mpirt/lib/intel64 IBRARY_PATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_ xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/lib/intel64 LSPATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/compiler/lib/intel64/locale/%l_%t/ %N:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/lib/intel64/locale/%l_%t/ %N:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/debugger/intel64/locale/%l_%t/%N ANPATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/man/en_US:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.3 19/man/en_US:/development/gcc- 4.3.0/man:/local/zkl/mpich2/man:/opt/jdk1.6.0_20/man:/usr/share/man/zh_CN:/usr/share/man:/usr/kerberos/man:/usr/local/share/man:/usr/X11R6/man:/usr/m an:/usr/local/man: INCLUDE=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/include FPATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/include CPATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/mkl/include PATH=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/composer_xe_2011_sp1.10.319/bin/intel64:***** 3. 安装编译openmpi 去http://www.open-mpi.org下载OpenMPI 1.6.5（更新的版本大抵也可以，笔者没测试），解压到/sob目录下，进入其目录，运行 ./configure FC=ifort F77=ifort prefix=/home/zly/openmpi165 make all install –j 此时openmpi的可执行文件、库文件、头文件等就被装到了/home/zly/openmpi165里面的对应目录下。 设置环境变量(sudo gedit ~/.bashrc)，在.bashrc中加入 export PATH=$PATH: /home/zly/openmpi165/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH: /home/zly/openmpi165/lib 输入(source ~/.bashrc)使环境变量生效。 4. 编译Nwchem6.5 1) 设置环境变量将Nwchem6.5解压到/home/zly/Nwchem-6.5，运行 export NWCHEM_TOP=/home/zly/nwchem-releases/nwchem-6.5 export NWCHEM_TARGET=LINUX64 export NWCHEM_MODULES="all python" export MPI_INCLUDE=/home/zly/openmpi165/include export MPI_LIB=/home/zly/openmpi165/lib export LIBMPI="-lmpi_f90 -lmpi_f77 -lmpi -ldl -Wl,--export-dynamic -lnsl -luti " export FC=gfortran export CC=fcc export CXX=g++ #export ARMCI_NETWORK=MPI-MT #export MSG_COMMS=MPI #export BLASOPT=" " export PYTHON_EXE=/usr/bin/python export PYTHONVERSION=2.7 export USE_PYTHON64=yes export PYTHONPATH=/usr/local/lib/python2.7/site-packages export PYTHONHOME=/usr export PYTHONLIBTYPE=a function renwc() { make FC=$FC ; pushd $NWCHEM_TOP/src ; make FC=$FC link ; popd } 2) 编译 cd /sob/Nwchem-6.5/src make nwchem_config make 3) 可执行文件生成在了/nwchem-6.5/bin/LINUX64下，把它加入PATH环境变量即可。 |
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5楼2015-05-24 17:42:10
6楼2015-05-26 13:03:36
