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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by 308047410 at 2015-05-23 10:20:43
还想问一下,如果选出来音舞之后要不要在软件上 评个分什么的 ?用什么软件 ?怎么评?谢谢 啦...

常见引物设计软件都没有对简并引物评分的操作,因为简并引物是一个引物集,真正起作用的只是其中部分,而对引物集中其他引物评价也就没有意义。不要纠结评价了,合成后做PCR评价吧,就算常规引物设计评价得分很高的引物也未必百分百好使。
11楼2015-05-23 17:13:08
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by 308047410 at 2015-05-23 10:20:43
还想问一下,如果选出来音舞之后要不要在软件上 评个分什么的 ?用什么软件 ?怎么评?谢谢 啦...

常见引物设计软件都没有对简并引物评分的操作,因为简并引物是一个引物集,真正起作用的只是其中部分,而对引物集中其他引物评价也就没有意义。不要纠结评价了,合成后做PCR评价吧,就算常规引物设计评价得分很高的引物也未必百分百好使。
12楼2015-05-23 17:13:16
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林之子云

新虫 (初入文坛)

我也是自己刚摸索用codehop设计引物,好难的感觉,
13楼2016-01-01 18:21:03
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羽化姚俊鹏

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by tency at 2015-05-20 21:54:00
1,先根据你比对的氨基酸位置确定引物上下游,根据一个氨基酸密码子对应3个碱基的关系,就可以确定上下游引物的距离。2,设计好的引物可以再oligo里评价一下,3,如果是几个蛋白质比对之后设引物的话,应该就是找保 ...

设计好的引物如何可以再oligo里评价?使用oligo必须输入一段长长的核酸序列才可以进行引物设计评价等等,最近正做这个卡壳了,恳请你施以援手,O(∩_∩)O谢谢!
志同道合
14楼2016-08-11 16:18:01
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羽化姚俊鹏

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by tency at 2015-05-20 21:54:00
1,先根据你比对的氨基酸位置确定引物上下游,根据一个氨基酸密码子对应3个碱基的关系,就可以确定上下游引物的距离。2,设计好的引物可以再oligo里评价一下,3,如果是几个蛋白质比对之后设引物的话,应该就是找保 ...

设计好的引物如何可以再oligo里评价?使用oligo必须输入一段长长的核酸序列才可以进行引物设计评价等等,最近正做这个卡壳了,恳请你施以援手,O(∩_∩)O谢谢!
志同道合
15楼2016-08-11 16:18:48
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谦虚求解

铜虫 (小有名气)

楼主,不知您是否解决该问题,方便的话,可以交流一下吗?
16楼2018-08-11 20:57:35
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