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lufuhao

木虫 (著名写手)

极品木虫

[交流] 做过PHYLIP进化树的前辈给指导一下

我使用蛋白序列做了一张进化树,用邻接法做的,作出来之后颇觉怪异!前辈给指导一下:
1. 分支处的的数值代表什么?我的自展次数使用1000,难道是指的这个?我看有的文献中说分支处为支持强度值,那么这个是怎么做出来的?两者有什么区别?

2. 我的序列为BmHEl,使用Astacin作为Outgroup,那么从图中可以看出什么?是不是应该换一换Outgroup?我实在不懂这东西,请高手们多多指教!

另外我的序列同源比较一般为30%多一点的相同性,这有没有说服力?我觉得好像有点悬!
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将心比心
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微笑漩涡

新虫 (著名写手)

相似度太低上了啊。数值代表1000次中存在此分支情况的次数。
2楼2008-07-17 10:55:46
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