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molly011

金虫 (著名写手)

[交流] transcipt variant的问题

一个mRNA有多个transcipt variant 不同的transcipt variant 代表什么意思
如果我的引物在俩个transcipt variant 都能匹配 这个引物可用吗 谢谢啦先
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★
molly011(金币+3,VIP+0):谢谢啦 我还有问题要问 有时间帮我一下吧 呵呵
就是不同的转录本
前体mRNA转录出来后,经过差异剪接可以形成不同的成熟转录本
如果你只想研究其中一种成熟转录本而排除另外一种,自然就需要在差异区域设计引物
如果想研究总体的转录情况,那就要在共同的区域设计引物
2楼2008-07-16 16:10:18
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molly011

金虫 (著名写手)

谢谢   我要用realtime检测该基因的表达情况 那我是从总体还是从单个来选择比较好呢
3楼2008-07-16 16:46:08
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

Realtime我没有做过
我感觉,这个要根据你的实验目的来决定
首先要查查文献,看看这两种不同转录本,转录产物(应该是不同的亚型)是否具有某些对方所没有的功能,假如你想研究的是这些功能的差异,自然就要针对不同转录本设计相应的引物
假如说,你想研究的是这个基因的一些common的功能,对于其亚型的特异功能不感兴趣,那么就要从总体上设计,这样才是反映最真实的情况。
4楼2008-07-16 16:51:51
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molly011

金虫 (著名写手)

好的 谢谢你 今天从你的帮助下学到不少东西,而且明白了自己还有很多的东西没有深究
5楼2008-07-16 16:56:52
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

不客气的说~~~
做实验就是要多多交流嘛~~呵呵
6楼2008-07-16 17:11:08
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