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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于引物的问题？
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yujie8586

银虫 (小有名气)

[交流] 关于引物的问题？

各位高手！我在文章中看到一对有用的引物，想应用到自己的实验中，但是此引物前面加了一段小写的碱基，我想知道它的意思和具体作用。
5-cgccagggttttcccagtcacgacGAIIIIGCIGGIGA(T\C)GGIACIACIAC-3
5-agcggataacaatttcacacagga(T\C)(T\G)I(T\C)(T\G)ITCICC(A\G)AAICCIGGIGC(T\C)TT-3
谢谢！
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1楼 2008-07-16 09:34:43
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allen8368

木虫 (正式写手)
你有没有发现凡是小写的都是正常碱基 而且是靠近5'端的序列
而大写的都是有特殊要求的比方说I或者干脆就是简并引物比方说（T/C）
这种引物的作用是靠后面的特殊碱基进行匹配 在进入第二轮的PCR时候就可以依靠前面的确定碱基来增强特异性
这种引物得使用方法有些类似于CODEHOP兼并引物PCR
具体的原理你可以去查一查  我在这里就不多说了
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慢慢的认识你，再慢慢的忘记你...........
2楼2008-07-16 10:38:04
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signal023

荣誉版主 (知名作家)

No stupid question, no q .

优秀版主
引用回帖:
Originally posted by allen8368 at 2008-7-16 10:38:
你有没有发现凡是小写的都是正常碱基 而且是靠近5'端的序列
而大写的都是有特殊要求的比方说I或者干脆就是简并引物比方说（T/C）
这种引物的作用是靠后面的特殊碱基进行匹配 在进入第二轮的PCR时候就可以依靠前 ...

说的很好哦
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欢迎常来“出国留学区”！
3楼2008-07-16 10:39:43
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playboy723

金虫 (正式写手)
也不懂   大家可不可以讲的细致点儿啊   他这样的设计引物的目的是什么？简并引物PCR?   望高手指点
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4楼2008-07-16 20:37:17
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xyklmu

至尊木虫 (知名作家)

虫眼看世界
2楼的讲得很好，支持一下，呵呵
赞一下 回复此楼
位卑未敢忘忧国。
5楼2008-07-17 06:27:56
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yujie8586

银虫 (小有名气)
感谢各位虫友，我再查查吧！！
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6楼2008-07-17 10:59:02
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