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【求助】极化率的计算？分子描述符号的归一化问题？Log P计算？
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问题一: 高斯计算得出的极化率是一组数据：xx，xy，yy，yz，xz，zz 如果只想以一个数据表示极化率，该怎样处理。我曾看到文献有提到-----平均极化率a=（axx+ayy+azz）/3，这种计算方法是否正确？各位大侠帮忙啊^_^ 问题二： 我的实验是计算分子描述参数，然后建立数学模型。建模时，是否需要将分子描述参数归一化，即换算成（-1，1）之间？ 问题三： Log P用不同软件计算结果不一样。我尝试了hyperchem，chemoffice，Cerius。将优化后的分子结构带入上述软件，结果相差较大。用hyperchem，chemoffice计算的Log P，优化前后结果都一样。这种情况如何取舍？ 在此先谢谢大家了。。。问题比较多哈 [ Last edited by zzgyb on 2008-7-20 at 18:46 ] |
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whitewatercn
银虫 (小有名气)
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suntao1982(金币+2,VIP+0):xiexie
taowanjun1223(金币+1,VIP+0):谢谢
suntao1982(金币+2,VIP+0):xiexie
taowanjun1223(金币+1,VIP+0):谢谢
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第二个问题,是否归一化,要看所使用的数学方法,比如用多元线性回归或PLS ,算法本身包括了数据的标准化处理,如果用ANN SVM 等方法,最好把数据先归一化. 第三个问题,hyperchem 的logp很不好,另外两个不太清楚,建议看看软件manual及相关文献,看看所用的方法的口碑如何。建议楼主使用xlogp3（用google找一下，有在线计算）。发表的文章中用得最多的就是clogp（商业）和xlogp(免费）。 [ Last edited by whitewatercn on 2008-7-17 at 15:22 ] |
3楼2008-07-17 15:12:23
yuhuobuku
木虫 (正式写手)
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2楼2008-07-15 10:24:20
