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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 生物信息学求助：序列比对相似性的获得？
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yf-deng

金虫 (正式写手)
非常感谢xyklmu兄，下面是我比对的序列，请您用DNAstar比对看看！再一次感谢！
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11楼2008-07-16 17:04:00
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yf-deng

金虫 (正式写手)
这是editseq文件
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12楼2008-07-16 17:05:39
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xyklmu

至尊木虫 (知名作家)

虫眼看世界
★ ★
yf-deng(金币+2,VIP+0):非常感谢您的解答
我用你给的序列，用Megalign程序比较了一下，得到的结果与你的并不一样的，我把几个截图放在一起了，你看看附件中的图片吧。
两两比较的相似性（similarity）好像挺高的，也有较低的。我用的是Lasergene 7.01软件包。
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位卑未敢忘忧国。
13楼2008-07-17 06:44:55
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yf-deng

金虫 (正式写手)
非常感谢您的解答，刚才我也用Lasergene 7.01软件包比对了以前的序列得到了和您一样的结果，发现前面的结构之所以和您比对的结果(和文献的结果很接近，看来文献中的也不一定准确)差异很大是因为我先前用的那个版本的DNAstar和Lasergene 7.01软件包导入序列的时候有差别，差别如下图。而换了另外的序列则没有出现此种情况。

另外还想请教，bioedit上的结果可信吗？还有就是您说一般发文章不用DNASTAR比对获得的相似性，那么您用clustalx或phlip是怎么样得到相似性的？有图示就更好了！谢谢！
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14楼2008-07-17 15:37:15
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