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yf-deng金虫 (正式写手)
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[交流]
生物信息学求助：序列比对相似性的获得？
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大家好，我在丁香园发了个http://www.dxy.cn/bbs/post/view? ... amp;tpg=1&age=0求助有关基因序列比对的帖，至今问题还是没有解决？还有就是要想知道一个物种的单个基因若想知道与其他物种的序列相似性是用多重比对还是目的基因与其他物种的基因两两比对？另一个物种的家族内基因的相似性呢？ [search]序列比对[/search] http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=73&id=12288520&sty=1&tpg=1&age=0 [ Last edited by yf-deng on 2008-7-15 at 14:47 ] |
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yf-deng
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3楼2008-07-15 14:49:17
xyklmu
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yf-deng(金币+2,VIP+0):谢谢您的回复，我马上把帖子贴出来
yf-deng(金币+2,VIP+0):谢谢您的回复，我马上把帖子贴出来
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你在丁香园的帖子看不到，还需要注册才可以浏览，何不把帖子的内容贴过来？？ 对于要想知道一个物种的单个基因其他物种的类似序列的相似程度有多大，一般是用多重对比的软件来测算，如DNASTAR（lasergene）、DNATOOL等。用这些软件既可以知道此基因和别的类似基因的两两之间的相似性和趋异性，也可以知道这个基因在整个谱系中的聚类或者是进化地位。同一个物种内的基因家族成员之间的关系也可以用这种多重比对来进行比较。另外进化树软件Philip也可以通过树形的形式展示基因家族内或者基因类似物的相似性或者趋异性，相互之间的关系可以用进化距离来表示的。 |
2楼2008-07-14 19:26:05
4楼2008-07-15 16:02:12
yf-deng
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5楼2008-07-16 01:23:25
40