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毕设小白请教用MS的pdb文件借助VMD转成lammps的data文件的问题 已有1人参与
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各位前辈好,我毕设是做一个分子动力学模拟,依照师姐的指导用MS建了模型然后导出pdb文件,再在VMD里打开 用 topo writelammpsdata xx.data charge命令来转data文件 建的模是纤锌矿结构的氧化锌,但是转出来的文件在电荷量那列全是0.00000 自己手动给改成了应该的2和-2后 运行lammps报错 format不对。。。。 紧急求教各位大神,这种情况如何能使VMD文件直接能导出带正确电荷值得的data文件(pbd文件和导出的data文件在附件里上传了) 感谢各位前辈的阅读 |
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2015-05-08 16:07:07, 473.24 K
2015-05-08 16:07:19, 152.15 K
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zs806750658
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