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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 我要建立固体的硝基苯，找不到原子坐标，怎么建模？
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hxxywwp

新虫 (小有名气)

[求助] 我要建立固体的硝基苯，找不到原子坐标，怎么建模？ 已有1人参与

各位，要建立分子晶体硝基苯的构型，查不到原子坐标，怎么建模？
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1楼 2015-05-07 10:37:58
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。。 2015-05-20 09:11:09
doi 10.1107/S0365110X5900250X
你看看这个文献
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2015-05-07 11:14:44
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
实在找不到的只能自己做结晶测XRD找人解析了
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3楼2015-05-07 11:15:34
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hxxywwp

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2015-05-07 11:15:34
实在找不到的只能自己做结晶测XRD找人解析了

非常感谢你，我找到了一篇文献，但是其中的一个原子坐标数据是错误了，如果其他的原子我按文献数据添加，而这个错误的原子我自己手动画一个可以吗？这样合理吗？
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4楼2015-05-07 15:37:01
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
4楼: Originally posted by hxxywwp at 2015-05-07 15:37:01
非常感谢你，我找到了一篇文献，但是其中的一个原子坐标数据是错误了，如果其他的原子我按文献数据添加，而这个错误的原子我自己手动画一个可以吗？这样合理吗？...

如果确定是错误的 可以自己添加 好在硝基苯的原子间相对位置还是很好确定的
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5楼2015-05-07 16:17:21
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hxxywwp

新虫 (小有名气)
内容已删除
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6楼2015-05-07 16:23:37
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
内容已删除
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7楼2015-05-07 16:42:58
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hxxywwp

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by pigrass at 2015-05-07 16:42:58
有问题就发论坛吧 我也不是什么都懂...

请问手动加一个H原子后优化整个晶胞的原子坐标，这样能让整个晶体达到结构稳定吗？
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8楼2015-05-16 18:29:59
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hxxywwp

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2015-05-07 11:14:44
doi 10.1107/S0365110X5900250X
你看看这个文献

你好！文献没有给出H原子的坐标，只给出了其他原子的坐标，怎么建模？
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9楼2015-05-16 18:31:26
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
9楼: Originally posted by hxxywwp at 2015-05-16 18:31:26
你好！文献没有给出H原子的坐标，只给出了其他原子的坐标，怎么建模？...

硝基苯的H不是只在苯环上吗，其他化学键连接好之后自动加H就行了啊
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10楼2015-05-20 09:24:02
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