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njut007

银虫 (小有名气)

[交流] [求助] 关于hyperchem及MOPAC软件优化结构的稳定问题

在Hyperchem中构建结构,并使用其自带的MM+分子力场对结构进行几何优化,将优化后的结构使用MOPAC中的AM1半经验方法,精度提高100倍优化,并使用高斯B3LYP/6-31g(d)方法分别计算两次优化后结构的单点能,结果显示使用MOPAC进行优化后结构的单点能量仅变小了10-5数量级大小,结构基本未发生变化,由此判断,Hyperchem优化后的结构已基本达到稳定状态,可用于QSAR的研究

请问这样说法合理吗?
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njut007

银虫 (小有名气)

我作这个说明是因为有个审稿专家提出一个意见:如何判断MOPAC二次优化之后的结构更加稳定呢,所以我想通过计算其单点能来说明这个问题,单点能变小就说明稳定
事实上计算出来的单点能确实变小了,但是变化的非常小,可以忽略不计,所以我考虑为什么使用MOPAC二次优化的结构没有很大变化呢?是不是因为之前的hyperchem的优化结构已经基本稳定,所以二次优化才没有多大变化呢?
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3楼2008-07-11 14:14:03
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
引用回帖:
使用MOPAC进行优化后,结构的单点能量仅变小了10-5数量级大小

是说
(1) MOPAC优化后的结构与MM+处理后的结构相比;
还是
(2) Gaussian B3LYP....的两次计算之间
或者
(3) MOPAC与Gaussian处理的结果之间
???
2楼2008-07-11 11:01:52
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