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木虫之王 (文学泰斗)

太阳系系主任

[交流] 【转贴】《Nature》 vol.454 (7201), (10 Jul 2008) 中文摘要【已搜索无重复】

《Nature》 vol.454 (7201), (10 Jul 2008) 中文摘要

封面故事:三聚埃博拉病毒糖蛋白的晶体结构

埃博拉病毒是最可怕的病原体之一,能引起严重出血热,人感染后的死亡率高达90%。1994年以来,这种病毒的爆发增加了四倍。虽然用灵长类动物所做的最初疫苗试验给人类带来了希望,但目前尚没有可供临床使用的疫苗或感染后的治疗方法。而且,科学家目前仍不清楚为什么该病毒致病能力这么强,为什么在致命病例中免疫反应这么弱。现在,来自斯克里普斯研究所的一个小组,确定了与从一个人类幸存者身上分离出来的一个中和抗体结合在一起的三聚埃博拉病毒糖蛋白的晶体结构。该结构显示了一个假设中的受体结合点,这个结合点被束缚在一个杯形体中,而这个杯形体是由三个GP1病毒附着亚单元(在本期封面图片上的分子表面模型中显示为蓝色)形成,被三个GP2融合亚单元(图上显示为白色)所包围。外部与这个点的联系受到一个聚糖帽及一个突出的、粘蛋白一样的区域的限制。病毒抗体(图上显示为黄色)将GP1亚单元和GP2亚单元桥接起来,并且对于GP2的融合前病毒表面构形是具有特异性的。封面图片:Christina Corbaci & Michael Pique。

视蛋白晶体结构已被确定
G-蛋白耦合受体(GPCRs)或七-跨膜受体构成人类基因组中最大的超级家族之一,并且也是一个共同的治疗目标。被光激发的分子视紫红质由一个被称为视蛋白的GPCR构成,其中心空间含有一个通过共价键结合的光敏辅因子“Retinal”。无配体的GPCRs极难纯化,但Park等人成功地从牛视杆细胞中获得了天然视蛋白的晶体,并以2.9埃的分辨率确定了其结构。该结构显示了一个供11-cis-retinal使用的入口通道和一个供all-trans-retinal使用的出口通道,这是关于GPRC激发这一有重要生物学意义的过程的一个实例。

双星小行星体系中卫星的形成机制
很多小行星和外海王星天体都有卫星:这样的天体目前共发现150个(http://tinyurl.com/dweqf)。这些双星体系中最小的是主带小行星和近地小行星,但这两种类型天体的环境很不相同,这使得人们难以设想出一个共同机制来解释它们的形成。现在,Walsh等人所介绍的一个模型填补了这一空白。目前所观测到的带有卫星的主带及近地小行星的性质,与涉及通过热YORP效应(在这种效应中,来自一个不规则天体的辐射会给该天体施加一个净作用力)发生的一个“碎石堆”小行星的慢速起旋(spin up)过程的模拟结果相匹配。从一个自旋天体的赤道上所摔掉的物质,如果是由发生能量耗散碰撞的粒子组成的话,会吸积进一颗卫星中。

月球上已经没有水了
尽管人们曾有争议地提出,月球上永久黑暗的、很深的极地碰撞坑中也许能发现水冰,但整个月球被认为早在导致其形成的灾难性的加热事件中就已经失去了几乎所有高挥发性元素,包括水。氢作为最轻的元素被认为已经完全失去。Saal等人利用最新二次质谱方法,获得了月球上最原始玄武岩——月球“火山玻璃”中原始挥发性成分(CO2、H2O、F、S、Cl)含量的更好的限定值。他们对火山喷发前水含量的最好估计值为745 p.p.m.,最低含量为260 p.p.m.。这表明,整个月球已经完全没有水和其他高挥发性成分了。

基于Borrmann效应的新型X-射线吸收光谱方法
Borrmann效应是X-射线衍射物理学中最为引人注目的现象之一,能使一个厚而不透明的晶体突然之间无法用X-射线观察到。X-射线能以精确判断的入射角度和波长穿透一个几乎没有任何吸收的晶体,似乎能够避免与原子平面发生相互作用。这是由于与原子产生的电偶所发生的相互作用有很大减小。现在,Pettifer等人发现,虽然Borrmann效应中原子上的电偶过渡减少,但更奇异的电四极矩(electric quadrupole)过渡却变得更为强烈。通过利用该效应,研究人员获得了一种新型X-射线吸收光谱方法,它能探测用其他方法难以测定的电子状态。在这项首创性的研究中,对来自钆镓石榴石的X-射线吸收光谱所做分析,显示了与吸收事件相关的明显的四极矩特征,其中一些是以前所不知道的。

地震断层的应力变化
在能够发生地震的深度处随时间变化的应力场,是了解地震触发机制的一个关键参数。因此,测量地震活动活跃的断层带内的应力变化,一直是地震学中人们长期追寻的一个目标。通过在1公里的深度对沿SAFOD (San Andreas Fault Observatory at Depth)示范点与位于Parkfield的主钻孔之间一条基线的地震波速度变化进行两个月的定点连续测量,Niu等人发现,由大气压变化诱导的应力变化的确是可以探测得到的。他们还发现了与被预测将产生大规模同震应力变化的两次地震巧合的速度变化。两次测量分别开始于两次地震之前约10小时和2小时,说明它们可能与断裂前膨胀扩张有关,与在早先实验室研究中所观测到的现象相似。

比目鱼特殊身体构造的演化
比目鱼的不对称性是发育过程中出现的形态分化的一个特例:从对称的幼虫开始,头骨形状发生变化,使一只眼睛越过头顶迁移到位于身体一边(或另一边)的另一只眼睛的旁边。这种安排的演化起源一直不清楚。Matt Friedman对名为Amphistium的鱼的始新世(距今大约4700万年)化石重新进行了研究,描述了一个新的属,它代表着已知最原始的比目鱼。在这些鱼身上,迁移的眼睛从未超过背部中线,即使在完全成年的鱼身上也是如此。这是从化石记录中发现的一种过渡形式的一个图例,它证实,比目鱼的特殊身体构造的演化是一个渐进的过程。

人类为了公共利益的合作
虽然人类经常进行相互合作,但放弃公共利益的诱惑大多数情况下会战胜集体合作行动,导致所谓的“公共财产悲剧”(tragedy of the commons)。很多现有模型平等对待不同个体,忽略了多样性和人口结构。Santos等人在理论上发现,通过异构任务图所产生的社会多样性,在公共财产游戏中能够促进合作的出现。
果蝇脑内有感知环境温度的神经元
大型动物用来监测环境温度变化的传感器在身体周围,人们普遍认为小型动物也是一样的。例如,人们假设昆虫是通过它们的触角来探测环境温度的。但科学家却在果蝇身上发现了能探测环境温度的大型热响应神经元,而且这些神经元还位于脑内。四种前脑神经元通过激发dTrpA1离子通道来对温度做出反应,研究人员假设,这样可提示果蝇去寻找更为适宜的环境。这些通道是破坏有害昆虫及传播疾病的昆虫热喜好行为的潜在目标。

骨髓瘤细胞对IRF4的依赖性
对与骨髓瘤细胞系的扩散相关的基因作为可能的药物治疗目标所做的一项RNA干涉扫描,发现淋巴细胞激发及正常细胞中浆细胞分化所需的转录因子IRF4是多发性骨髓瘤的一个主要调控因子。令人吃惊的是,骨髓瘤细胞完全依赖于IRF4,尽管它们大多数都不含有IRF4位点的突变、转位或放大。在癌细胞中,IRF4控制一个不同的基因网络,包括MYC致癌基因,它们不同于正常浆细胞或被激发的B细胞。骨髓瘤中的IRF4依赖性是“非致癌基因上瘾”现象的一个例子,在该现象中,癌细胞依靠一个正常细胞蛋白来扩散和/或存活。

HIV-1病毒颗粒组合过程的实时观察
研究人员首次在活细胞中直接观测到了一个病毒颗粒的组合体。研究人员利用基于“全内反射荧光显微镜”的方法和表达荧光蛋白标记的Gag(HIV-1的主要结构成分)衍生物的活HeLa细胞,实时观察到了HIV-1病毒的单个颗粒。他们获得的影片资料解决了这样一个争议:HIV-1组合体出现在细胞中的什么地方?他们发现,病毒颗粒各自出现在胞质膜上,并在大约5、6分钟内聚集在一起。
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