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vortex673金虫 (初入文坛)
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基因酷版友及螺旋网友组织编写《生物信息学分析系列图书》，热切期待虫友的参与！
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关于出版《生物信息学分析系列图书》 基因酷生物信息版组织论坛会员编写《生物信息学分析系列图书》，书的稿费/版权/署名均为作者所有。欢迎有志于展示自己才华和实力的虫友一起参与进来。请联系Raindyok@126.com 书暂定名： 《生物信息学分析实践》或《生物信息分析实例》 主 编：未定 编 委：Downsea、Raindy、Soofree、Lily、言午、二马、孤风逐日、庄军、嘟嘟盖＋期待你的加入... 编委档案：略 暂定目录：如下 引用: 序 第1章 生物信息学简介 第2章 数据库搜索 Entrez-NCBI、SRS-EBI、BIOMART、BLAST 第3章 引物设计及测序结果分析 第一节 引物设计 3.1.1引物分析概述 3.1.2 引物分析流程：引物设计的原则、引物质量的评价 3.1.3引物分析软件：Primer Premier 5.0、Oligo6.03 3.1.4 引物分析示例 本地化软件：Primer Premier 5.0(设计引物) ＋ Oligo6.03(引物质量评估) 在线工具：ligonucleotide Properties Calculator＋ Oligo Calculator(引物质量评估) 第二节 序列拼接 3.2.1 拼接简介 3.2.2 序列拼接实例：DNAMAN＋ VectorNTI中的ContigExpress＋DNAstar中的Seqman 第三节 测序结果分析Chromas（查看峰图）－实例分析 第4章 核苷酸序列分析 第5章 氨基酸序列分析 是否56两章合并？ 5.1理化性质分析 5.2功能域分析 5.2.1 疏水性 5.2.2 跨膜区 5.2.3信号肽 5.2.4 Coil区 5.2.5低复杂度区 5.2.6 Domain 5.3功能位点分析(基序分析或Motif搜索) 第6章 蛋白质空间结构 6.1空间结构预测 6.2二级结构预测 PHD 6.3三级结构预测 6.3.1同源模建 6.3.2折叠识别 6.3.3从头预测 第7章 系统发育分析 7.1系统发育分析简介：定义、原理 7.1.1建树方法与流程：NJ法、ML法、MP法的原理、优缺点、选择原则 7.1.2 建树工具：PAUP、PHYLIP、MEGA、、TreeView 7.1.3建树分析示例 PAUP建树＋MEGA构建NJ树＋PHYLIP建ML树＋MrBayes建ML树 第8章 抗原决定簇预测 是否有必要？ 8.1简介 8.2分析示例 8.3肽段选择原则 第9章 RNA分析 9.1简介 9.2RNA二级结构 9.3MicroRNA分析 第10章 参考文献管理 10.1简介 10.2三大软件实例分析 10.2.1Endnote 10.2.2ReferenceManager 10.2.3NoteExpress 第11章 生信编程 计划安排： 2008年7-8月 逐步整理，确定编写内容、人员、分工， 2008年9月 各成员自行安排写作 2009年1-2月 完成初稿，上交 欢迎有志于展示自己才华和实力的朋友一起参与进来。 有意者可以跟帖或者EMail给：Raindyok@126.com 对于书刊的建议或提议大家也可以跟帖提出，谢谢！ QQ群：13559330 |
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