| 查看: 1677 | 回复: 1 | ||
[求助]
Avogadro 纤维素建模 已有1人参与
|
|
大家好，最近在做纤维素溶解于离子液体的分子模拟研究。我想描述一下用Avogadro程序来建立纤维素分子模型的步骤，请大家看有没有问题。 我想研究一条单链溶解于离子液体的机理，所以我只要建立一个聚合度为10的纤维素链。 step 1. 画出葡萄糖的结构，采用程序自带的AutoOptimization, 直到能量不再变化，此后AutoOptimization一直打开，即对结构操作时也同时在优化结构； step 2. 复制9个葡萄糖； step 3. 删除相应的羟基，依次将这10个分子连接起来，直到能量不再变化时停止； step 4. 运行conformer search 找出能量最低的构象 我的问题是，每次按以上步骤得到的分子构象都有一定差异，但能量接近，是否任意一个稳定的构象都可以用来做分子模拟？ 其次，如果我想得到一条直链，需要有怎样的操作？ 或者，大家有其他推荐的画分子结构的软件吗？最好适用于OS X系统 多谢大家！ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
ilschem.cn
新虫 (小有名气)
- 应助: 72 (初中生)
- 金币: 169.5
- 红花: 5
- 帖子: 201
- 在线: 36.2小时
- 虫号: 3653289
- 注册: 2015-01-19
- 性别: GG
- 专业: 化学反应工程
2楼2015-04-28 18:36:31
