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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】Dmol模块中，优化后结构变化
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wwj1982770771

铁虫 (知名作家)

[交流] 【求助】Dmol模块中，优化后结构变化

各位大虾，我用做固体催化剂表面吸附，Dmol模块；结构优化以后，加入气体分子，再做结构优化，发现催化剂结构变化比较明显，而且气体分子也移动了位置，不知到怎么回事？各位帮帮忙吧

[ Last edited by zzgyb on 2008-7-8 at 12:31 ]
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1楼 2008-07-06 21:05:11
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
你这个情况都是正常的
如果有别的你觉得不能控制的或者不合理的问题 你应该描述出来
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2楼2008-07-07 19:47:11
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saitou

木虫 (正式写手)
★
suntao1982(金币+1,VIP+0):谢谢交流!
加了新东西优化肯定会有变化吧，如果和你摆放的初始位置没差别才需要担心了
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不抛弃，不放弃
3楼2008-07-07 20:59:10
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wwj1982770771

铁虫 (知名作家)
谢谢大侠帮忙，
主要是我的Pt－C－O本来是直线的，优化后Ni-C-O变倾斜，这个正常吗？
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4楼2008-07-07 21:17:09
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mengsk

金虫 (著名写手)
我也有同感，Dmol很难收敛，通过增大smearing值熟练后，得出怪异的结果！请高手多多指教！
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奋斗中的小木虫
5楼2008-07-07 21:21:05
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awpsr

金虫 (正式写手)

快快乐乐小青虫
★ ★
suntao1982(金币+2,VIP+0):谢谢交流!
底物模型需要构建三层以上,如果电脑性能不够的话,就锁定其中的一两层.层数越多结果越精确,但是相应的计算量要大大增加,所以要充分考虑电脑的配置.
     优化后结构肯定要变化的了,我也是做吸附分子的.如果是化学吸附的话,吸附后要重新成键的,所以原子的位置要发生形变.
    smearing也不能加太大,不然重复性不好,如果收敛不是一直减小的话,就是结构有问题,需要将吸附的分子改变位置,你应该多看看文献里面有没有相应的模型构建.下次记得把图发上来,这样就好看了.
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世上本没有人， 路走多了便成了人
6楼2008-07-13 19:36:19
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yehaibin52

银虫 (初入文坛)
大家好啊，想请教高手一个问题，我在CASTEP中计算了一个体系当添加一个离子后的分子动力学，结果已经出来了，但我不知道怎么将计算的离子的轨迹调出来，又如何做成动画呢？请大家给解答一下。谢谢。
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7楼2008-07-23 15:00:39
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