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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请问有没有批量的把EST翻译成蛋白质的方法？
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我爱吃水果

金虫 (正式写手)

[交流] 请问有没有批量的把EST翻译成蛋白质的方法？

得到了好多EST序列，想翻译成蛋白质
不知道怎么才快一些
怎么翻译的准确些
求助大侠啊
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爱学习！爱运动！我爱吃水果！o(∩_∩)o...哈哈
1楼 2008-07-05 21:55:45
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genomelin

银虫 (小有名气)
感觉应该先和本地服务器上的数据进行blastx，结果不好的那些提出来做tblastx，只要把base相对于基因的位子定出来就容易的多吧～～用perl 写几个程序很容易能搞定的
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2楼2008-07-06 01:30:03
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我爱吃水果

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by genomelin at 2008-7-6 01:30:
感觉应该先和本地服务器上的数据进行blastx，结果不好的那些提出来做tblastx，只要把base相对于基因的位子定出来就容易的多吧～～用perl 写几个程序很容易能搞定的


怎样和本地服务器上的数据进行blastx？？？
不会写程序
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爱学习！爱运动！我爱吃水果！o(∩_∩)o...哈哈
3楼2008-07-06 08:01:23
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famingdong

木虫 (正式写手)
不是有很多网站可以翻译吗
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4楼2008-07-06 15:33:07
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genomelin

银虫 (小有名气)
1.如果实验室没有服务器的话，可以在NCBI上做blastX，如果有服务器，可以自己照着ncbi的要求安装，再把你感兴趣的data从ncbi的FTP上下来，作为formatdb的输入文件
2.网上有按照6种读码框进行翻译的网站
http://www.expasy.ch/tools/dna.html
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5楼2008-07-07 10:37:10
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我爱吃水果

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by genomelin at 2008-7-7 10:37:
1.如果实验室没有服务器的话，可以在NCBI上做blastX，如果有服务器，可以自己照着ncbi的要求安装，再把你感兴趣的data从ncbi的FTP上下来，作为formatdb的输入文件
2.网上有按照6种读码框进行翻译的网站
[url]ht ...

谢谢！
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爱学习！爱运动！我爱吃水果！o(∩_∩)o...哈哈
6楼2008-07-08 08:15:27
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