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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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我爱吃水果

金虫 (正式写手)

[交流] 请问有没有批量的把EST翻译成蛋白质的方法?

得到了好多EST序列,想翻译成蛋白质
不知道怎么才快一些
怎么翻译的准确些
求助大侠啊
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爱学习!爱运动!我爱吃水果!o(∩_∩)o...哈哈
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genomelin

银虫 (小有名气)

感觉应该先和本地服务器上的数据进行blastx,结果不好的那些提出来做tblastx,只要把base相对于基因的位子定出来就容易的多吧~~用perl 写几个程序很容易能搞定的
2楼2008-07-06 01:30:03
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我爱吃水果

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by genomelin at 2008-7-6 01:30:
感觉应该先和本地服务器上的数据进行blastx,结果不好的那些提出来做tblastx,只要把base相对于基因的位子定出来就容易的多吧~~用perl 写几个程序很容易能搞定的


怎样和本地服务器上的数据进行blastx???
不会写程序
爱学习!爱运动!我爱吃水果!o(∩_∩)o...哈哈
3楼2008-07-06 08:01:23
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famingdong

木虫 (正式写手)

不是有很多网站可以翻译吗
4楼2008-07-06 15:33:07
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genomelin

银虫 (小有名气)

1.如果实验室没有服务器的话,可以在NCBI上做blastX,如果有服务器,可以自己照着ncbi的要求安装,再把你感兴趣的data从ncbi的FTP上下来,作为formatdb的输入文件
2.网上有按照6种读码框进行翻译的网站
http://www.expasy.ch/tools/dna.html
5楼2008-07-07 10:37:10
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我爱吃水果

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by genomelin at 2008-7-7 10:37:
1.如果实验室没有服务器的话,可以在NCBI上做blastX,如果有服务器,可以自己照着ncbi的要求安装,再把你感兴趣的data从ncbi的FTP上下来,作为formatdb的输入文件
2.网上有按照6种读码框进行翻译的网站
[url]ht ...

谢谢!
爱学习!爱运动!我爱吃水果!o(∩_∩)o...哈哈
6楼2008-07-08 08:15:27
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