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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子轨迹
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敏sunflower

金虫 (小有名气)

[求助] 分子轨迹 已有2人参与

请求各位大侠的帮助！
在模拟分子在膜中扩散情况的文章中，常常会见到displacement-时间的曲线图(附件1)，用来描述分子在膜中的运动形式；此外，还有一种图是描述分子在膜中的运动轨迹图（附件2），各位大神有没有会做的呐？

分子轨迹
displacement-时间图.GIF


分子轨迹-1
运动轨迹图.GIF
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1楼 2015-04-14 16:47:58
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 敏sunflower at 2015-04-15 09:13:25
你好，能不能说的详细一点呐？具体应该如何操作呐？...

用的软件不同, 方法不同.
MS我不知道有没有这种功能, 其他的程序, 如VMD, JMol都可以对轨迹进行叠加, 并显示出来
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敏sunflower
7楼2015-04-15 09:27:46
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普通回帖

敏sunflower

金虫 (小有名气)
自己顶一下，希望各位大神多多指点，金币会不断奉上的
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2楼2015-04-14 16:49:14
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
敏sunflower(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-04-15 07:31:55
只要有相应的数据，作图就很简单了，用tecplot 就可以了，关键是模拟数据文本。
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3楼2015-04-14 19:44:03
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
敏sunflower(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-04-15 07:32:04
第二种图你把轨迹累加一下就可以了
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敏sunflower
4楼2015-04-15 00:15:17
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by jerkwin at 2015-04-15 00:15:17
第二种图你把轨迹累加一下就可以了

你好，能不能说的详细一点呐？具体应该如何操作呐？
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5楼2015-04-15 09:13:25
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chuntao118 at 2015-04-14 19:44:03
只要有相应的数据，作图就很简单了，用tecplot 就可以了，关键是模拟数据文本。

你好，请问你知道在MS中怎样输出上图中需要的数据吗
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6楼2015-04-15 09:23:43
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by jerkwin at 2015-04-15 09:27:46
用的软件不同, 方法不同.
MS我不知道有没有这种功能, 其他的程序, 如VMD, JMol都可以对轨迹进行叠加, 并显示出来...

VMD、JMol这些软件我查了一下，应该都是一些数据处理软件吧，我怎样才能从Materials studio的动力学结果中得到上面轨迹图所需要的数据呐？
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8楼2015-04-15 09:49:25
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 敏sunflower at 2015-04-15 09:49:25
VMD、JMol这些软件我查了一下，应该都是一些数据处理软件吧，我怎样才能从Materials studio的动力学结果中得到上面轨迹图所需要的数据呐？...

你去看MS的分析工具啊, 如果没有你需要的功能, 你就需要自己编程完成
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9楼2015-04-15 11:02:26
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by jerkwin at 2015-04-15 11:02:26
你去看MS的分析工具啊, 如果没有你需要的功能, 你就需要自己编程完成...

哦。好的
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10楼2015-04-15 19:43:20
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