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铜虫 (初入文坛)

[求助] 16S的问题 已有2人参与

我做了PCR,用的是通用引物ITS4和ITS5,我现在不知是去EzBioCloud比对还是去GenBank比对。。。我不懂扩的方式是不是16S,我觉得引物ITS4和ITS5扩的方式不是16S的。。。有高手帮忙解答吗
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Freedomqqc

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
its不是扩增的真菌吗?细菌鉴定菌种,我用的是扩征16s全长哪个7F,1492R
科研不易,希望自己能够坚持
2楼2015-04-15 10:18:33
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kittykbh

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼上说的对的,lz貌似用错了真菌的引物。EzBioCloud上面都是已经发表的菌株,可以作为模式菌株比对,
genbank上面的片段太多,不可信的也比较多,看lz是做什么了,要是发表新菌,建议用EzBioCloud
3楼2015-04-15 20:36:47
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