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wangling209

铜虫 (初入文坛)

[求助] 基因序列相关问题

有谁知道thyroid peroxidase和thyroid peroxidase-like基因序列之间的关系,本人最近在克隆thyroid peroxidase基因序列,可是克隆出来的序列时而比对上thyroid peroxidase,时而又比对上thyroid peroxidase-like,不知道怎么办了,而且还不知道相关的资料在哪里可以查的到,这里先多谢了

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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
wangling209: 金币+5, 翻译EPI+1 2015-04-13 12:56:40
你的问题没有说清楚。我估计应该不是基因序列,更应该是mRNA (cDNA)序列。还有你克隆的方法是什么?如果是cDNA,那么用的应该是RT-PCR?还是从cDNA库中筛选的?还有你研究的对象是什么?

不管是哪种方法,所得到的克隆如果不是一个东西,那么与所用的引物(如果是PCR)有关系,或者筛选探针(如果是从cDNA库中筛选)有关。根本的原因是TPO和thyroid peroxidase-like基因之间(在mRNA水平上)有相当的同源性所致,特别是在你选用的引物或探针部分同源性太高了,所以特异性不好,得到了不止一种东西。
其实也无关紧要,只要用你的目的克隆(TPO)不就可以了吗?
2楼2015-04-13 04:32:50
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wangling209

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2015-04-13 04:32:50
你的问题没有说清楚。我估计应该不是基因序列,更应该是mRNA (cDNA)序列。还有你克隆的方法是什么?如果是cDNA,那么用的应该是RT-PCR?还是从cDNA库中筛选的?还有你研究的对象是什么?

不管是哪种方法,所得到 ...

恩恩,是mRNA (cDNA)序列,基因序列和mRNA (cDNA)序列不是一样的吗,是RT-PCR做的,克隆出来的序列,最相近的是TPO,其次是thyroid peroxidase-like
3楼2015-04-13 12:55:54
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