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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 文件发送到服务器上计算，断开xshell连接，计算停止
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】

[求助] 文件发送到服务器上计算，断开xshell连接，计算停止

如题，为什么断开连接后高斯计算会停止呢？
请问如何解决？

补充一下，我是用一个批处理文件提交的任务，不是利用命令行提交的，下面是批处理文件内容：
#!/bin/bash
for inf in *.gjf
do
outf=`echo ${inf}|tr "gjf" "out"`
/db/home/haha/g09/g09 < ${inf} > ${outf}
done
我在网上查看到有的说加上g09 test.com&，有的说加上nohup g09 *.com &
我不知道这是什么意思，也不知道怎么加进去，麻烦高手帮忙。
（由于我想每次提交任务提交多个，所以才用批处理；再说我不懂linux系统，命令行提交我也不会。所以，做了一个批处理文件，每次都用这个，方便一些。这种方法在我自己的电脑上屡试不爽，但是用在服务器上总是遇到各种问题，呵呵。）
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1楼 2015-04-11 15:09:50
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lastzealot: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-04-11 17:50:12
lastzealot: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-04-11 23:59:03
gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2015-04-12 06:37:00
没有用nohup交，当然退出登录后会掉。
如果你的这个脚本名字叫  “bats.sh” ，那么，用命令“nohup sh bats.sh&” 来提交作业，再退出应该就不会掉了
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2楼2015-04-11 16:45:17
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lastzealot: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-04-11 17:50:19
用setsid代替nohup

或者可以考虑用screen

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3楼2015-04-11 17:00:15
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】
引用回帖:
2楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2015-04-11 16:45:17
没有用nohup交，当然退出登录后会掉。
如果你的这个脚本名字叫  “bats.sh” ，那么，用命令“nohup sh bats.sh&” 来提交作业，再退出应该就不会掉了

谢谢
我还有一个小问题
在这个文件中我需要把g09所在的目录写上，也就是
/db/xxx/xxx/g09/g09
怎么才能不写前面那一长串目录名，直接写g09就可以了？
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4楼2015-04-11 17:51:28
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】
引用回帖:
3楼: Originally posted by qchem at 2015-04-11 17:00:15
用setsid代替nohup

或者可以考虑用screen

谢谢
我还有一个小问题
在这个文件中我需要把g09所在的目录写上，也就是
/db/xxx/xxx/g09/g09
怎么才能不写前面那一长串目录名，直接写g09就可以了？
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5楼2015-04-11 17:51:41
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫
引用回帖:
4楼: Originally posted by lastzealot at 2015-04-11 17:51:28
谢谢
我还有一个小问题
在这个文件中我需要把g09所在的目录写上，也就是
/db/xxx/xxx/g09/g09
怎么才能不写前面那一长串目录名，直接写g09就可以了？...

将路径加入环境变量，即：
export PATH=/db/home/haha/g09:$PATH
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6楼2015-04-11 17:59:28
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】
引用回帖:
6楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2015-04-11 17:59:28
将路径加入环境变量，即：
export PATH=/db/home/haha/g09:$PATH...

谢谢
请问这一串命令是写在xshell里面？还是写在批处理文件中？
写完了以后g09前面就可以不写路径了吗？

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7楼2015-04-11 18:45:25
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lastzealot at 2015-04-11 18:45:25
谢谢
请问这一串命令是写在xshell里面？还是写在批处理文件中？
写完了以后g09前面就可以不写路径了吗？
...

写在.bashrc里

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8楼2015-04-11 19:45:48
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】
引用回帖:
8楼: Originally posted by qchem at 2015-04-11 19:45:48
写在.bashrc里
...

又晕了 这又是什么文件

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9楼2015-04-11 21:26:19
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by lastzealot at 2015-04-11 21:26:19
又晕了 这又是什么文件
...

你需要学习一些linux的基本知识

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10楼2015-04-12 05:56:41
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