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[资源] 【推荐】一个优秀的免费的可视化软件VESTA

估计有些朋友已经很熟悉这个软件,在这里再向那些不知道的朋友先介绍一下VESTA,下一个话题介绍如何用我自己编的fortran小代码提取vasp程序计算所得的CHARGCAR中的电荷密度或自旋密度,并用VESTA可视化,从而得到漂亮的三维或二维电荷密度图。
1. Inrtoduction
VESTA is a 3D visualization program for structural models and 3D grid data such as electron/nuclear densities. Some of the novel features of VESTA are listed below.

Deal with structural models and volumetric data at the same window.
Support multiple tabs corresponding to files.
Support multiple windows with more than two tabs in the same process.
Deal with virtually unlimited number of objects such as atoms, bonds polyhedra, and polygons on isosurfaces (theoretical limit on 32bit operating system is 1,073,741,823)
Support lattice transformation from conventional to non-conventional lattice by using matrix. The transformation matrix is also used to create superlattice and sublattice.
Visualize interatomic distances and bond angles that are restrained in Rietveld analysis with RIETAN-FP.
Transparent isosurfaces can be overlap with structural models.
Isosurface can be colored on the basis of another physical quantity.
Arithmetic operations among multiple volumetric data files.
High quality smooth rendering of isosurfaces and sections.
Export high-resolution graphic images exceeding Video card limitation.
MUCH better performance than VICS and VEND. For example, bonds search speed in VESTA is several to thousands times faster than that in VICS. Algorithm for calculation of isosurface geometry is more than six times efficient than that in VEND.


2. Supported file formats
Input
Structure data

VESTA format (*.vesta)
VICS format (*.vcs)
American Mineralogist Crystal Structure Database (*.amc)
asse (*.asse)
Chem3D
CIF (Crystallographic Information File)
CrystalMaker text file (*.cmt)
CSSR (Crystal Structure Search and Retrieval)
CSD/FDAT
DL_POLY CONFIG
FEFF input file
GEOMETRY.OUT output by the EXCITING FP-LAPW Code
ICSD (Inorganic Crystal Structure Database)
ICSD-CRYSTIN
MDL Molfile
MINCRYST (Crystallographic Database for Minerals)
MOLDA
PDB (Protein Data Bank)
Input file of RIETAN-FP (*.ins)
Output file of RIETAN-FP (*.lst)
WIEN2k (*.struct)
XMol XYZ (*.xyz)
F01 for SCAT and C04D for contrd
MXDORTO/MXDTRICL FILE06.DAT, FILE07.DAT
XTL file (*.xtl)

Volumetric data
PRIMA (*.pri; *.prim)
MEED/PRIMA text data (*.den)
Energy Band (*.eb)
General volumetric-data format (*.?ed)
Periodic volumetric-data format (*.grd)
SCAT volumetric-data files (*.sca, *.scat)
WIEN2k (*.rho) obtained with wien2venus.py
WinGX 3D Fourier (*.fou)
X-PLOR/CNX (*.xplor)
Structure & volumetric data
GAMESS input and 3D surface data files output by MacMolPlt
Gaussian Cube format
VASP
XCrySDen XSF format


Output
Structure data

Original format of VESTA (*.vesta)
Chem3D
CIF (Crystallographic Information File)
DL_POLY CONFIG
PDB (Protein Data Bank)
Standard input file of RIETAN-FP (*.ins)
XMol XYZ
VRML
P1 structure
Fractional coordinates
Input files of MADEL

Volumetric data
General volumetric-data format (*.3ed)
Periodic volumetric-data format (*.grd)
Graphic formats (raster image)
BMP
EPS
JPEG
JPEG 2000
PNG
PPM
RAW
RGB (SGI)
TGA
TIFF
Graphic formats (vector image)
EPS
PDF
PS
SVG


VESTA http://www.geocities.jp/kmo_mma/crystal/en/vesta.html




碳纳米管自旋密度2D效果图


碳纳米管自旋密度3D效果图

[ Last edited by wuchenwf on 2009-6-13 at 23:09 ]
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shinecoke

银虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

抢到第二楼,虽然没见过楼主的软件,不过,听起来,挺神奇的。
2楼2008-07-03 08:00:20
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zyyzff

铜虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

!!!!!!!!!!!!!
forturn高手
3楼2008-07-03 21:14:22
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liuds7792

金虫 (小有名气)


到哪里找去?baidu  google都没找到
4楼2008-10-09 21:19:00
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

不错,我也看看
5楼2008-10-10 18:18:02
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fansw1129

铁杆木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐


顶一把
6楼2009-03-02 08:30:34
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

能给出程序就好了
7楼2009-03-02 15:52:32
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y1ding

铁杆木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主是做有限长的碳管?
VESTA的主页不怎么好上,国内的IP段似乎被禁了。
8楼2009-03-02 19:05:09
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zhangdelin0000

木虫 (著名写手)


支持师兄一下!!!
10楼2009-03-04 09:18:51
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jghe

金虫 (著名写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

顶啊,请问你的下一个主体在那里,我很关注阿
11楼2009-03-04 20:03:47
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dalongmao

木虫 (正式写手)


看效果不错,可惜程序不懂
12楼2009-03-05 07:44:53
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TIGERYZZ

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好东西,先下下来,希望楼主还能分享一下使用经验
13楼2009-03-05 10:19:07
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veryman

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶先,支持一个
14楼2009-03-05 11:55:08
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psp828

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

具体应该怎么操作啊,能不能演示一下啊?
15楼2009-03-21 15:37:59
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)


Vasp&MedeA存档
16楼2009-06-13 21:33:07
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)


怎么操作的,LZ能否详细说明一下呢 。。。
17楼2009-06-17 17:09:15
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简单回复
tangsw9119楼
2009-03-03 09:10   回复  
 
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