24小时热门版块排行榜    

查看: 2739  |  回复: 10

xixi1007

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by beefly at 2015-04-16 23:54:10
M^1/2 * hessian * M^1/2就是质量加权的hessian。M是原子量矩阵。Matlab语言的写法是
sqrtm(M) * hessian *  sqrtm(M)。

有的对角化程序不需要提前计算质量加权的hessian。Matlab命令:
=eig(hessian,M); q=d ...

您好!我以NMA分子为例计算了此分子的振动频率和hessian矩阵,如下图所示,第一列是gaussian计算得到的30个振动模式的频率。第二列是将Hessian after L703后面的矩阵对角化后取其中最后的30个本征值,第二例是将Force constants in Cartesian coordinates后面的矩阵对角化后取其中最后的30个本征值,可以看出这两列的值是非常相近的,但其本证矢量是不一样的。所以我不确定这两个哪一个是质量加权的hessian矩阵。
另外,图中第四列是第一例和第二例的比值,如按您所说5140.48715246*sqrt(q)就是转换成波数单位的振动频率,那这个比值应该是5140.48715246,可这里显然不是啊。
同时,Vibrational analysis in Gussian 中说,将质量加权的hessian矩阵对角化后,其本征值就是基本频率,之后gaussian将其转换成波数的单位cm-1并输出。如果是这样的话,第四列也应该是一个常数啊,起码应该比较相近吧。
gaussian计算频率时输出的hessian是那一部分啊
NMA.jpg

11楼2015-04-20 14:54:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xixi1007 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +5 Doleres 2026-03-19 5/250 2026-03-19 20:14 by 制度的
[考研] 288求调剂 +14 于海海海海 2026-03-19 14/700 2026-03-19 19:40 by maocaozhuxi
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +4 脱颖而出 2026-03-16 12/600 2026-03-19 16:17 by 脱颖而出
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +5 枫桥ZL 2026-03-18 7/350 2026-03-19 14:52 by 功夫疯狂
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +3 Ncdx123456 2026-03-19 3/150 2026-03-19 13:18 by houyaoxu
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +7 小材化本科 2026-03-18 7/350 2026-03-19 10:46 by Linda Hu
[考研] 332求调剂 +3 ydfyh 2026-03-17 3/150 2026-03-19 10:14 by 功夫疯狂
[考研] 0703化学 305求调剂 +4 FY_yy 2026-03-14 4/200 2026-03-19 05:54 by anny19840123
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +7 步川酷紫123 2026-03-13 7/350 2026-03-18 17:12 by 尽舜尧1
[考研] 311求调剂 +11 冬十三 2026-03-15 12/600 2026-03-18 14:36 by 星空星月
[考研] 070300化学319求调剂 +6 锦鲤0909 2026-03-17 6/300 2026-03-18 13:22 by Iveryant
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 26考研求调剂 +6 丶宏Sir 2026-03-13 6/300 2026-03-17 16:13 by 醉在风里
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
信息提示
请填处理意见